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    马秀丽,宋敏训,于可响,廖明,辛朝安. 我国鸭肝炎病毒分离株基因组的测定与分析[J]. 华南农业大学学报, 2009, 30(1). DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.2009.01.020
    引用本文: 马秀丽,宋敏训,于可响,廖明,辛朝安. 我国鸭肝炎病毒分离株基因组的测定与分析[J]. 华南农业大学学报, 2009, 30(1). DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.2009.01.020
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    MA Xiu-li,SONG Min-xun,YU Ke-xiang,LIAO Ming,XIN Chao-an. Sequencing and Analysis of the Genome of Duck Hepatitis Virus Isolated from China[J]. Journal of South China Agricultural University, 2009, 30(1). DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.2009.01.020
    Citation: MA Xiu-li,SONG Min-xun,YU Ke-xiang,LIAO Ming,XIN Chao-an. Sequencing and Analysis of the Genome of Duck Hepatitis Virus Isolated from China[J]. Journal of South China Agricultural University, 2009, 30(1). DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.2009.01.020
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    我国鸭肝炎病毒分离株基因组的测定与分析

    Sequencing and Analysis of the Genome of Duck Hepatitis Virus Isolated from China

      摘要
    • 摘要: 对我国鸭病毒性肝炎病毒(Duck hepatitis virus,DHV)分离株YZ和CL的全基因组进行了序列测定分析.结果表明,2分离株的基因组全长分别为7 713 nt和7 709 nt,包括626 nt的5′UTR、6 747 nt的ORF、314 nt的3′UTR以及23 nt和19 nt的poly(A)尾.结构蛋白VP0含有保守的四肽CPRP,VP3的N端存在一段约20个氨基酸的碱性氨基酸富集区域;VP1缺少RGD(Arg-Gly-Asp)基序.DHV2分离株存在3个不相关的2A蛋白基序,其中2A1蛋白类似口蹄疫病毒属的2A蛋白,2A2蛋白与AIG1蛋白(拟南芥)和GTPase更为相似,2A3蛋白则与副肠孤病毒属的2A2蛋白类型相似;2C蛋白含有保守基序EPxxxxxxGxxGxGK(S/T)、QxxxxxDDxxQ和KGxxxxSxxxxxS/T.3C蛋白含有催化三联体H38-D69-C144;3D蛋白包含KDELR、DxxxxD、GxxSGxxxTxxxNx、YGDD和FLKR等RNA聚合酶的特征基序.基于多聚蛋白、VP1、2C和3C蛋白的进化关系分析结果均表明,DHV分离株与副肠孤病毒属的遗传关系最近,但占据一个清晰的独立遗传谱系,应将DHV单独划属.

       

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