聂庆华,方梅霞,李伟民,谢亮,张细权. 鸡pATGL基因的电子克隆及比较基因组分析[J]. 华南农业大学学报, 2008, 29(2): 94-98. DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.2008.02.023
    引用本文: 聂庆华,方梅霞,李伟民,谢亮,张细权. 鸡pATGL基因的电子克隆及比较基因组分析[J]. 华南农业大学学报, 2008, 29(2): 94-98. DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.2008.02.023
    NIE Qing-hua,FANG Mei-xia,LI Wei-min,XIE Liang,ZHANG Xi-quan. Electronic Cloning and Comparative Analysis of the Chicken pATGL Gene[J]. Journal of South China Agricultural University, 2008, 29(2): 94-98. DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.2008.02.023
    Citation: NIE Qing-hua,FANG Mei-xia,LI Wei-min,XIE Liang,ZHANG Xi-quan. Electronic Cloning and Comparative Analysis of the Chicken pATGL Gene[J]. Journal of South China Agricultural University, 2008, 29(2): 94-98. DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.2008.02.023

    鸡pATGL基因的电子克隆及比较基因组分析

    Electronic Cloning and Comparative Analysis of the Chicken pATGL Gene

    • 摘要: 利用生物信息学和比较基因组学方法对鸡 pATGL(predicted adipose triglyceride lipase)基因的结构、表达和功能进行了分析,结果表明:(1)电子克隆获得的鸡pATGL基因cDNA全长1 788 bp,包括1 452 bp的编码区和5'UTR(70 bp)、3'UTR(266 bp),编码合成483个氨基酸的多肽;(2)鸡pATGL基因全长在30 kb以上,包含9个外显子和8个内含子,其中内含子1(约20 kb)远远长于其他区域;(3)鸡pATGL蛋白的相对分子质量为53 600,不含信号肽,具有GXSXG(氨基乙酸-X-丝氨酸-X-氨基乙酸)脂肪酶活性结构和Patatin结构域,可能存在5个 N 端朝内的跨膜螺旋结构;(4)基于cDNA及EST数据库的检索显示,鸡pATGL基因在腹脂、胸腺、黏液囊、脾、骨髓、垂体、下丘脑和松果腺、心脏、软骨组织、小脑、卵巢乃至胚胎等组织中表达;(5)鸡 pATGL 基因与CD151、RPLP2 位于5号染色体的紧密连锁群,这种连锁关系与人、小鼠以及狗紧密一致.

       

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