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尖孢镰刀菌对秀丽隐杆线虫生物学特性及表达转录组的影响

易杏盈, 肖月, 张东华, 刘丽, 闫晓慧, 伍建榕

易杏盈, 肖月, 张东华, 等. 尖孢镰刀菌对秀丽隐杆线虫生物学特性及表达转录组的影响[J]. 华南农业大学学报, 2024, 45(3): 381-389. DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.202308007
引用本文: 易杏盈, 肖月, 张东华, 等. 尖孢镰刀菌对秀丽隐杆线虫生物学特性及表达转录组的影响[J]. 华南农业大学学报, 2024, 45(3): 381-389. DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.202308007
YI Xingying, XIAO Yue, ZHANG Donghua, et al. Effects of Fusarium oxysporum on the biological characteristics and expression transcriptome of Caenorhabditis elegans[J]. Journal of South China Agricultural University, 2024, 45(3): 381-389. DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.202308007
Citation: YI Xingying, XIAO Yue, ZHANG Donghua, et al. Effects of Fusarium oxysporum on the biological characteristics and expression transcriptome of Caenorhabditis elegans[J]. Journal of South China Agricultural University, 2024, 45(3): 381-389. DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.202308007

尖孢镰刀菌对秀丽隐杆线虫生物学特性及表达转录组的影响

基金项目: 国家重点研发计划(2019YFD100200X);国家自然科学基金(31860208);云南省教育厅项目(11070733);云南省高校森林灾害预警控制重点实验室开放基金(ZKJS-S-202207)
详细信息
    作者简介:

    易杏盈,硕士研究生,主要从事森林病理学研究,E-mail: 821995421@qq.com

    通讯作者:

    张东华,讲师,博士,主要从事资源微生物利用研究,E-mail: 1391967127@qq.com

    伍建榕,教授,博士,主要从事森林病理和资源微生物利用研究,E-mail: 1176279044@qq.com

  • 中图分类号: S432.44;S423.45

Effects of Fusarium oxysporum on the biological characteristics and expression transcriptome of Caenorhabditis elegans

  • 摘要:
    目的 

    探讨尖孢镰刀菌Fusarium oxvsporum对秀丽隐杆线虫Caenorhabditis elegans生物学特征的影响,明确线虫响应尖孢镰刀菌侵染的关键通路。

    方法 

    将尖孢镰刀菌活性孢子和灭活孢子分别与秀丽隐杆线虫共培养,测定C. elegans寿命、体长、运动能力、繁殖力以及咽泵运动速率等基本生物学特征;进行全基因组测序,通过GO和KEGG分析明确线虫响应尖孢镰刀菌侵染的关键通路和生物学功能。

    结果 

    尖孢镰刀菌活性分生孢子与线虫共培养可导致线虫寿命下降,虫体显著缩短,线虫繁殖力显著降低;但共培养并未对线虫的咽泵运动速率及运动能力产生明显影响。GO分析发现,差异表达基因富集在先天免疫反应和氧化还原酶活性等生物学功能方面;KEGG分析发现,差异表达基因富集在药物代谢——细胞色素P450、代谢外源性物质的细胞色素P450和脂肪酸代谢等通路。

    结论 

    尖孢镰刀菌对秀丽隐杆线虫的基本生命活动有不利影响,这为深入探讨线虫响应尖孢镰刀菌的天然免疫机制及与植物免疫的相似性,从而寻找植物相关抗病基因奠定了基础。

    Abstract:
    Objective 

    To investigate how Fusarium oxysporum affects the fundamental biological traits of nematodes (Caenorhabditis elegans), and identify the critical mechanism of nematode responding to F. oxysporum infection.

    Method 

    The active and inactive spores were cocultured with C. elegans to determine the biological characteristics of C. elegans, such as lifespan, body length, motility/reproductive ability and pharyngeal pumping rate. The whole genome sequencing was performed to find the key pathways and biological functions of nematode responding to F. oxysporum infection by GO and KEGG analysis.

    Result 

    The coculture with active spores shortened the longevity of nematodes, significantly decreased the body size and reduced the reproductive ability of nematodes. However, the coculture did not obviously affect the pharyngeal pumping rate and motility ability of nematodes. GO analysis showed that the differentially expressed genes were enriched in biological functions such as innate immune response and oxidoreductase activity. KEGG analysis showed that the differentially expressed genes were enriched in cytochrome P450 metabolizing drug, cytochrome P450 metabolizing xenobiotics, fatty acid metabolism and other pathways.

    Conclusion 

    F. oxysporum has adverse effects on the basic life activities of C. elegans, which provides insight into the natural immune mechanism of nematodes in response to F. oxysporum and the similarity with plant immunity, so as to find plant-related disease resistance genes.

  • 氮是植物生长发育必需的大量元素之一,影响植物生长发育的许多方面,尤其是对叶绿素合成、光合作用以及干物质的积累与分配有着至关重要且不可替代的作用[1]

    中国是全球最大的氮肥生产国和消费国,在占世界7%的耕地上消耗了全球35%的氮肥。作为世界上粮食安全压力最大的国家,中国自20世纪90年代成功地实现了粮食基本自给,氮肥在其中发挥了巨大的作用[2]。但近期大量研究证明,氮肥用量已经超过了作物的需要,在经济作物体系中,尤其是大田作物,氮肥施用过量已是普遍现象[3-5]。目前,我国的氮肥生产量和消耗量居世界首位,不合理施氮和过量施氮问题严重。实际生产中,作物对氮肥的需求量很难精确,而且由于“施氮量越大作物的产量越高”错误思想的影响,农民往往施用远超过作物需求的氮肥。过量的氮肥施用导致其利用率较低[6-8]

    作物的氮素营养一般来源于土壤和肥料,但花生等豆科作物能根瘤固氮,依赖根瘤、土壤、人工施肥三者提供氮素,三者之间既互相关联又相互制约[9-10]。长期大量氮肥的投入不仅使得花生氮素利用效率降低,同时也抑制了自身的固氮能力,直接影响花生产量的提高和粮食安全[11]。因此,在保持花生高产和优质的同时降低氮肥施用量至关重要,对降低农业生产成本、促进农业可持续发展、保护生态环境具有重要意义。近年来,越来越多的学者聚焦氮高效品种的筛选和推广,旨在通过提高花生氮素利用效率来降低氮肥施用量、稳定产量,进而缓解过量施氮造成的一系列问题[12]

    本试验通过研究81份花生品种的19项与花生氮效率相关的指标,通过主成分分析与聚类分析,筛选出花生对氮肥最敏感的指标以及氮敏感型与氮不敏感型花生品种,为后续花生氮高效品种的筛选与培育提供理论依据。

    试验于2021年在广东省广州市增城区华南农业大学宁西教学科研基地进行,试验地位于23°24′N、113°64′E,属于亚热带季风气候,气温高、雨水光照充足、夏季长、霜降期短,年平均降水量1800 mm,年平均气温22.0~28.0 ℃。试验地前茬作物为水稻,土壤类型为红壤土,耕作层0~20 cm,pH 4.85~5.16;土壤养分状况:有机质 12.38~19.47 g/kg,碱解氮92.26~119.95 mg/kg,速效磷54.18~60.45 mg/kg,速效钾187.42~227.56 mg/kg。

    试验材料为81份来自世界各地的花生品种。

    大田试验设低氮和正常施氮2个处理,正常施氮处理施用尿素225 kg/hm2,低氮处理施用尿素0 kg/hm2。起垄栽培,垄距100 cm,垄面宽85 cm,垄上3行花生,行距33 cm,株距15 cm,每穴1粒,每小区20穴,共20株。播种前施150 kg/hm2 P2O5(对应过磷酸钙1250 kg/hm2)和150 kg/hm2 K2O(对应氯化钾250 kg/hm2),所有肥料均作为基肥一次性施入。3月初播种,7月初收获,水分管理及病虫草害等管理防治措施同当地要求。

    于花生收获期每小区随机选取5株长势一致的花生植株进行考种,按照《花生栽培观察记载技术规范》[13]进行考种,指标包括主茎高、主茎节数、主茎粗、侧枝长、分枝数、百果质量、百仁质量、百果仁质量、总果数、单株生产力等产量与产量构成指标。考种完的花生植株分成根、茎、叶和荚果,在105 ℃杀青20 min,然后在75 ℃烘干至恒质量,最后使用精度为0.01g 的电子秤测定不同部位干质量并计算总干质量。

    于花生苗期每小区随机选取3片大小、颜色一致的功能叶进行叶绿素a、叶绿素b以及类胡萝卜素含量的测定。采用二甲基亚砜(DMSO)浸提法,用打孔器取新鲜叶片约0.2 g(避开主叶脉),放入7 mL DMSO原液的试管中(试管最好用磨口玻璃塞密封,以免液体挥发影响测定结果),置于60 ℃ 恒温水浴条件下避光浸提一定时间(由15 min至几小时,根据植物叶片厚度和角质化程度而定),直至用肉眼观察叶片颜色变白为止。叶绿素被DMSO浸提干净后,把浸提液倒入刻度试管。叶片用DMSO洗涤2 ~ 3次,洗液一并倒入刻度试管,最后用DMSO定容到10 mL。然后取200 μL DMSO叶绿素浸提液于酶标板中,用酶标仪测定D470 nmD649 nmD665 nm

    氮响应系数(Nitrogen response coefficient,NRC):

    $${\rm{NRC}}= \dfrac{(正常施氮处理指标-低氮处理指标)}{低氮处理指标}\text{,} $$ (1)

    不同花生品种各综合指标的隶属函数值:

    $$ u\left(X_{j}\right)=\left(X_{j}-X_{\rm{min}}\right)/\left(X_{{\rm{max}}}-X_{\rm{min}}\right), \;j=\mathrm{1,2},\cdots n, $$ (2)

    各综合指标的权重:

    $$ w_{j} = \dfrac{P_{j}}{\displaystyle\sum _{j=1}^{n}P_{j}}\text{,} $$ (3)

    各花生品种综合氮敏感指数大小:

    $$ D=\displaystyle\sum _{j=1}^{n}\left[u\left(X_{j}\right) w_{j}\right],$$ (4)

    式中,Xj表示第j个综合指标;Xmin表示第j个综合指标的最小值;Xmax表示第j个综合指标的最大值;wj表示第j个综合指标在所有综合指标中的重要程度即权重;Pj为各花生品种第j个综合指标的贡献率;D为各花生品种在不同氮处理下由综合指标评价所得的氮敏感性综合评价值。

    以81份花生品种19项指标氮响应系数为原始数据,利用SPSS降维分析中的因子分析,抽取大于1的特征值得出各主成分的贡献率、成分矩阵及特征向量矩阵。由表1得出,因子分析提取了6个主成分,其贡献率分别为第1主成分19.955%,第2主成分19.358%,第3主成分12.361%,第4主成分8.767%,第5主成分7.656%,第6主成分5.596%,累计贡献率73.694%,说明可以解释原始数据73.694%的总变异,可以代替绝大多数指标做一个概括。因此,选择前6个主成分,将原来的19个单项指标组合为6个新的互相独立的综合指标,由此来代表原始19个指标携带的大部分信息。

    表  1  各综合指标的贡献率及特征向量1)
    Table  1.  Contribution rate and eigenvector of each composite index
    指标 ItemC1C2C3C4C5C6
    叶绿素a含量 Chlorophyll a content −0.435 0.756 −0.295 −0.082 −0.069 0.040
    叶绿素b含量 Chlorophyll b content −0.404 0.705 −0.143 0.170 0.225 0.009
    总叶绿素含量 Total chlorophyll content −0.488 0.800 −0.277 −0.026 0.003 0.032
    类胡萝卜素含量 Carotenoid content −0.462 0.738 −0.307 −0.031 −0.004 −0.028
    百果质量 100-pod weight −0.056 0.427 0.704 −0.229 −0.350 0.101
    百仁质量 100-kernel weight −0.216 0.136 0.635 0.022 −0.042 0.299
    百果仁质量 100-fruit kernel weight −0.035 0.471 0.681 −0.258 −0.316 0.083
    单株果数 No. of fruits per plant 0.783 0.321 −0.125 −0.364 0.013 −0.034
    单株生产力 Yield per plant 0.848 0.398 0.023 −0.224 0.080 −0.046
    果干质量 Fruit dry weight 0.846 0.416 0.023 −0.206 0.092 −0.046
    根干质量 Root dry weight 0.367 0.002 −0.361 −0.099 −0.006 0.384
    茎干质量 Stem dry weight 0.449 0.161 0.004 0.684 −0.256 −0.170
    叶干质量 Leaf dry weight 0.105 −0.063 −0.143 0.327 −0.241 0.624
    总干质量 Total dry weight 0.636 0.431 0.046 0.460 −0.189 0.054
    主茎高 Main stem height −0.041 0.196 0.299 0.646 −0.090 −0.216
    主茎节数 Number of main stem nodes −0.096 0.225 0.454 0.063 0.573 0.057
    侧枝长 Lateral branch length 0.132 0.093 0.405 0.160 0.667 −0.142
    分枝数 Number of branches 0.317 0.498 −0.275 0.124 0.182 0.027
    主茎粗 Main stem diameter 0.079 −0.078 0.040 0.159 0.432 0.556
    特征值 Eigenvalue 3.791 3.678 2.349 1.666 1.455 1.063
    贡献率/% Contribution rate 19.955 19.358 12.361 8.767 7.656 5.596
    累计贡献率/% Cumulative contribution rate 19.955 39.313 51.674 60.442 68.098 73.694
     1) C1~C6分别为第1~6主成分
     1) C1−C6 are the first to sixth principal components, respectively
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    特征向量矩阵能够反映出各个指标在每个主成分当中的载荷,在第1主成分当中,单株生产力(0.848)、果干质量(0.846)、单株果数(0.783)和总干质量(0.636)的特征向量较大,起主要作用,解释为花生产量性状因子;在第2主成分当中,总叶绿素含量(0.800)、叶绿素a含量(0.756)、类胡萝卜素含量(0.738)和叶绿素b含量(0.705)的特征向量较大,起主要作用,解释为花生光合色素含量因子;在第3主成分当中,百果质量(0.704)、百果仁质量(0.681)和百仁质量(0.635)的特征向量较大,起主要作用,解释为花生产量构成因子;在第4主成分当中,茎干质量(0.684)和主茎高(0.646)的特征向量较大,起主要作用,解释为花生茎秆性状因子;在第5主成分当中,侧枝长(0.667)和主茎节数(0.573)的特征向量较大,起主要作用,解释为花生株型因子;在第6主成分当中,叶干质量(0.624)、主茎粗(0.556)和根干质量(0.384)的特征向量较大,起主要作用,解释为花生干物质转移因子。根据各主成分贡献率大小及各指标在不同主成分中的特征向量,得出总叶绿素含量(29.146%)、叶绿素a含量(28.501%)、单株生产力(27.811%)和总干物质积累(27.458%)所占比例最大,表明叶绿素含量、单株生产力和干物质积累最能代表不同类型花生品种对氮素的响应情况。

    用上述主成分分析抽取的6个综合指标作为评价花生氮敏感性的基础值,利用公式(2)分别计算81份花生品种的隶属函数值u(Xj)。对于同一个综合指标如第1主成分而言,编号47的花生品种u(Xj)最大,为1.000,表明此品种在第1主成分表现为氮敏感性最强,而编号44的花生品种u(Xj)最小,为0.000,表明此品种在第1主成分表现为氮敏感性最弱。然后根据6个综合指标的大小,利用公式(3)求出其权重,最后利用公式(4)计算花生品种综合氮敏感性评价指标(D),D越大说明该花生品种的氮敏感性越高。以上述所得的综合评价指标(D)作为原始数据,采用欧式距离平方法和Word最小方差法进行聚类分析,将81份供试花生品种分为氮敏感型(Ⅰ类)、中间型(Ⅱ类)和氮不敏感型花生品种(Ⅲ类)(表2)。

    表  2  供试花生品种氮敏感等级及分类1)
    Table  2.  Nitrogen sensitivity level and classification of peanut cultivars under test
    品种编号
    Culticar number
    氮敏感类型(等级)
    Nitrogen sensitivity type (Grade)
    u(X1)u(X2)
    HN (1,11,45,47,49,58,92,116,122,123,127,162,166) 氮敏感型(Ⅰ)
    Nitrogen-sensitive type
    0.519a 0.677a
    HN (2,4,7,9,16,43,53,55,61,62,69,80,84,86,88,90,91,93,102,110,
    115,128,130,133,134,135,147,148,152,153,158,160,164)
    中间型(Ⅱ)
    Intermediate type
    0.165b 0.369b
    HN (12,14,15,18,19,26,27,29,31,32,34,44,46,48,65,72,77,79,85,
    8798,104,106,113,114,118,121,125,132,136,143,144,151,161,165)
    氮不敏感型(Ⅲ)
    Nitrogen-insensitive type
    0.101c 0.216c
     1) 同列数据后的不同小写字母表示不同氮敏感型花生品种差异显著(P < 0.05,LSD法)
     1) Different lowercase letters of the same column indicate significant differences among peanut cultivars of different nitrogen-sensitive types (P < 0.05,LSD method)
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    对聚类出的3种类型花生进行氮敏感性评价,通过对比6个主成分的平均隶属函数值,u(X1)和u(X2)的平均值在不同类型花生品种间差异显著(表2),其余4个均无显著差异。某一主成分的u(Xj)值越大说明该类型花生在该主成分的氮敏感性越强,氮不敏感型(Ⅲ类)花生品种u(X1)和u(X2)的平均值最小,氮敏感性最低;中间型(Ⅱ类)花生品种的u(X1)和u(X2)的均值为0.165和0.369,氮敏感性介于氮敏感型(Ⅰ类)花生品种和氮不敏感型(Ⅲ类)花生品种之间;氮敏感型(Ⅰ类)花生品种的u(X1)和u(X2)的平均值最高,说明其产量及产量构成因素和叶片光合色素含量对氮肥的敏感性最强。

    图1A~1E可得,施氮对不同氮敏感型花生品种的主茎高无显著影响,对主茎节数、侧枝长、分枝数与主茎粗表现出了不同程度的影响。相较于氮不敏感型(Ⅲ类)花生品种来说,正常施氮可以显著提高氮敏感型(Ⅰ类)品种的主茎节数、侧枝长及分枝数和中间型(Ⅱ类)花生品种的侧枝长、分枝数及主茎粗。与低氮处理相比,正常施氮处理仅显著提高了氮敏感型(Ⅰ类)花生品种的分枝数(32.53%),虽然对其主茎高、主茎节数及侧枝长没有达到显著影响,但相较于低氮处理也分别增加了17.86%,33.04%和21.25%;而正常施氮处理对中间型(Ⅱ类)和氮不敏感型(Ⅲ类)花生品种的农艺性状影响较小。由此可以说明氮不敏感型花生品种的农艺性状受氮肥影响较小,而氮肥对氮敏感型花生品种的株型结构影响较为明显。

    图  1  施氮对不同氮敏感型花生品种农艺性状、产量及构成因素的影响
    不同小写字母表示组间氮响应系数在0.05水平差异显著;“*”表示氮肥处理间在0.05水平差异显著(LSD法)
    Figure  1.  Effect of nitrogen application on agronomic traits, yield and composition factors of peanut cultivars with different nitrogen sensitivities
    Different lowercase letters indicate significant differences in nitrogen response coefficient at 0.05 level among groups; “*” represents significant differences at 0.05 level between nitrogen application treatments (LSD method)

    图1F~1J可得,施氮对不同氮敏感型花生品种的单株产量、总果数、百果质量、百仁质量和百果仁质量表现出了不同程度的影响趋势。相较于氮不敏感型(Ⅲ类)花生品种来说,正常施氮可以显著提高氮敏感型(Ⅰ类)花生品种的单株产量、总果数、百果质量及百果仁质量和中间型(Ⅱ类)花生品种的单株产、百果质量、百仁质量及百果仁质量。与低氮处理相比,不同氮敏感型的花生品种在正常施氮处理下的百果质量、百仁质量与百果仁质量均无显著变化,仅在单株生产力及总果数上表现出了不同程度的变化趋势。虽然百果质量、百仁质量、百果仁质量在氮肥处理间没有达到显著差异,但氮敏感型(Ⅰ类)和中间型(Ⅱ类)花生品种的产量在正常施氮处理下显著提高,与低氮处理相比分别提高了189.50%和30.40%,且氮敏感型(Ⅰ类)花生品种的总果数在正常施氮处理下也显著提高了120.80%。

    百果质量与单株结果数是决定花生产量的2大关键因素。因此在百果质量差异不显著的情况下,氮不敏感型(Ⅲ类)花生品种产量受施氮影响较小是因为其单株结果数在低氮处理下就能维持较高水平,而氮敏感型(Ⅰ类)花生品种的单株结果数在施氮处理下显著提高,从而使得产量大幅上升。

    图2A~2E可得,施氮对不同氮敏感型花生品种的根干质量和叶干质量无显著影响,对果干质量、茎干质量及总干质量表现出了不同程度的影响趋势。相较于氮不敏感型(Ⅲ类)花生品种来说,正常施氮可以显著提高氮敏感型(Ⅰ类)花生品种的果干质量、茎干质量及总干质量和中间型(Ⅱ类)花生品种的果干质量及总干质量。与低氮处理相比,不同氮敏感型的花生品种在正常施氮处理下各部位及总干物质积累均表现出了不同程度的变化趋势。正常施氮显著提高了氮敏感型(Ⅰ类)花生品种的果干质量(202.92%)、根干质量(55.03%)、茎干质量(59.61%)、叶干质量(114.80%)和总干质量(100.78%);也显著提高了中间型(Ⅱ类)花生品种的果干质量(30.52%)、叶干质量(50.44%)和总干质量(26.53%)。

    图  2  施氮对不同氮敏感型花生品种干物质积累和苗期光合色素含量的影响
    不同小写字母表示组间氮响应系数在0.05水平差异显著;“*”表示氮肥处理间在0.05水平差异显著(LSD法)
    Figure  2.  Effect of nitrogen application on dry matter accumulation and seedling photosynthetic pigment contents of peanut cultivars with different nitrogen sensitivities
    Different lowercase letters indicate significant differences in nitrogen response coefficient at 0.05 level among groups; “*” represents significant differences at 0.05 level between nitrogen application treatments (LSD method)

    干物质积累是荚果产量形成的基础,尤其是生育后半期的干物质积累会显著影响产量。相较于氮不敏感型(Ⅲ类)花生品种,氮敏感型(Ⅰ类)和中间型(Ⅱ类)花生品种的叶干质量、总干质量和果干质量受施氮处理影响较大。

    图2F~2J可得,施氮对不同氮敏感型花生品种的叶绿素b含量没有显著影响,对叶绿素a含量、总叶绿素含量和类胡萝卜素含量表现出了不同程度的影响趋势。与中间型(Ⅱ类)和氮不敏感型(Ⅲ类)花生品种相比,正常施氮可以显著增加氮敏感型(Ⅰ类)花生品种苗期的叶片叶绿素a含量、总叶绿素含量和类胡萝卜素含量。与低氮处理相比,正常施氮处理对中间型(Ⅱ类)和氮不敏感型(Ⅲ类)花生品种苗期叶绿素a含量、叶绿素b含量、总叶绿素含量和类胡萝卜素含量无显著影响,但可以显著增加氮敏感型(Ⅰ类)花生品种苗期的叶片叶绿素a含量、总叶绿素含量和类胡萝卜素含量。说明正常施氮处理对氮敏感型(Ⅰ类)花生品种前期的叶绿素含量的提升作用显著高于中间型(Ⅱ类)和氮不敏感型(Ⅲ类)花生品种。

    对花生品种19个性状的氮响应系数进行相关性分析,由表4可知大多数性状间的相关性都达到了显著或极显著水平。在正常施氮处理下,产量分别与单株果数、总干质量和分枝数呈极显著相关,与根干质量和茎干质量呈显著相关。干物质尤其是生育后半期的积累是荚果产量形成的基础,并且花生干物质在不同器官中的分配也会显著影响产量。分枝数等株型因子不仅直接影响叶片的有效光合面积,而且还会影响冠层结构内部水分、光照、CO2、温度等环境,最终影响群体的光合效率和作物产量。说明施氮主要通过影响花生干物质积累与分配及株型结构进而影响花生荚果产量的形成。

    表  4  不同花生品种各性状氮响应系数间的相关性矩阵1)
    Table  4.  Correlation matrix between nitrogen response coefficients of different peanut cultivars for each trait
    项目 ItemX1X2X3X4X5X6X7X8X9X10X11X12X13X14X15X16X17X18X19
    X11.000
    X20.593**1.000
    X30.963**0.772**1.000
    X40.839**0.658**0.870**1.000
    X50.1720.1140.1760.111.000
    X60.0210.0590.0410.0460.440**1.000
    X70.190.1690.1980.1350.849**0.408**1.000
    X8−0.042−0.101−0.076−0.0760.048−0.1840.0901.000
    X9−0.039−0.103−0.083−0.0720.129−0.1350.1770.867**1.000
    X10−0.036−0.069−0.071−0.0630.132−0.1320.1810.865**0.998**1.000
    X11−0.031−0.097−0.06−0.078−0.185−0.225*−0.1220.285*0.243*0.244*1.000
    X12−0.062−0.063−0.085−0.103−0.027−0.010−0.0640.1350.258*0.270*0.0491.000
    X13−0.043−0.039−0.049−0.06−0.093−0.025−0.105−0.019−0.010−0.0130.1260.1091.000
    X140.0260.0610.015−0.0230.141−0.0310.1460.427**0.561**0.568**0.1950.693**0.231*1.000
    X150.0030.221*0.0610.080.1490.0740.177−0.171−0.041−0.027−0.1330.334**0.0140.268*1.000
    X160.0420.253*0.1040.0590.190.2110.207−0.0570.0310.041−0.118−0.141−0.0580.0780.1321.000
    X17−0.1110.077−0.08−0.1010.0480.1750.073−0.0080.1780.186−0.0860.071−0.1040.0510.1250.438**1.000
    X180.1670.353**0.226*0.277*−0.029−0.059−0.0180.348**0.353**0.377**0.1260.238*−0.0250.406**−0.044−0.0580.0781.000
    X19−0.089−0.002−0.084−0.127−0.0830.095−0.114−0.0320.0360.0430.065−0.0150.028−0.0020.0370.0820.0980.0911.000
     1) X1:叶绿素a含量;X2:叶绿素b含量;X3:总叶绿素含量;X4:类胡萝卜素含量;X5:百果质量;X6:百仁质量;X7:百果仁质量;X8:单株果数;X9:单株生产力;X10:果干质量;X11:根干质量;X12:茎干质量;X13:叶干质量;X14:总干质量;X15:主茎高;X16:主茎节数;X17:侧枝长;X18:分枝数;X19:主茎粗;“*”和“**”分别表示在0.05和0.01水平显著相关(Pearson法)
     1) X1: Chlorophyll a content; X2: Chlorophyll b content; X3: Total chlorophyll content; X4: Carotenoid content; X5: 100-fruit weight; X6: 100-kernel weight; X7: 100-fruit kernel weight; X8: No. of fruit per plant; X9: Yield per plant; X10: Fruit dry weight; X11: Root dry weight; X12: Stem dry weight; X13: Leaf dry weight; X14: Total dry weight; X15: Main stem height; X16: Number of main stem nodes; X17: Lateral branch length; X18: Number of branches; X19: Main stem diameter; "*" and "**" indicate significant differences at 0.05 and 0.01 levels respectively (Pearson method)
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    氮素是限制作物生长和产量形成的重要元素,增施氮肥可以提高花生的光合能力、氮素积累、总生物量和荚果产量,但会降低其氮素利用效率,影响花生的新陈代谢。想要实现作物高产和农业生产中的减肥减量,就必须在优化氮肥施用量的同时提高氮肥利用率,保障作物的产量和品质[14-15]。而选育氮高效品种,提高作物氮肥利用效率,在保障作物产量和品质的前提下降低氮肥施用量,则是解决过量施氮和肥料利用率低下等问题的有效途径之一[16-17]。当下培育和筛选作物不同氮响应基因以及研究氮高效的基因已经成为国内外的研究热点之一,更有人将氮素高效利用的研究称为“第二次绿色革命”。

    评价作物氮敏感性的指标有很多,其中多为叶绿素含量、干物质积累及氮素积累等,但对于不同作物的氮敏感性评价指标尚未统一。因为筛选指标受作物类型、土壤环境及筛选时期的影响有较大差异。目前,水稻、马铃薯、油菜、玉米、棉花等作物氮高效品种筛选试验方法与相关指标构建体系已经较为成熟[18-21]。花生作为豆科植物还具有根瘤固氮功能,对氮素吸收与利用的机理更为复杂,迄今为止相关研究报道较少。本试验参照前人的筛选体系和研究方法,结合花生自身生长发育特点,对81份花生品种的19项相关指标的氮响应系数进行主成分分析及聚类分析,将81份花生品种分为氮敏感型(13)、中间型(33)及氮不敏感型(35),并得到苗期叶绿素含量、收获期分枝数和干物质积累为花生氮敏感型品种筛选指标。叶绿素是重要的光合色素,是光合作用的基础,而氮素作为花生生长发育所需的大量元素之一,与花生优质高产紧密相关,作为合成叶绿素的重要元素影响叶片的光合作用进而影响碳水化合物的积累,同时也影响相关碳氮代谢酶的活性。由于花生具有根瘤固氮功能,其叶绿素含量随生育时期的推迟对氮肥的需求减少而越来越小,所以在实际生产中可以通过观察花生苗期的叶色来初步判断其对氮肥的敏感性。氮素利用效率是评价作物氮高效品种的重要指标,但花生作为豆科植物,其氮素来源除土壤和肥料外还有根瘤固氮,不同花生品种最适宜的氮肥浓度差异较大,因此,花生的氮高效品种筛选指标应选取受氮肥水平影响较小的氮素收获指数;在适宜的施氮范围内,干物质积累与氮素积累呈显著正相关[22],所以干物质积累可以在很大程度上反映作物的氮素积累,且较直接测定氮素积累而言更容易实现。在水稻、小麦、玉米、番茄、棉花和马铃薯等作物中也筛选出了叶绿素含量、干物质积累等作为氮高效品种的筛选指标[23-28]。以上指标获取方法较为简单且客观,受人为主观因素影响较小;其次评价指标是通过科学严谨的筛选方法得出,可以为今后作物氮敏感性评价提供理论依据。

  • 图  1   尖孢镰刀菌孢子在NGM板上的生长情况

    Figure  1.   Growth of Fusarium oxysporum spores on NGM plates

    图  2   尖孢镰刀菌对线虫存活率的影响

    “*”“**”“***”分别表示相同时间处理与对照(NS)在0.05、0.01和0.001水平差异显著(t检验)

    Figure  2.   Effect of Fusarium oxysporum on Caenorhabditis elegans survival rate

    “*” “**” and “***” indicate that there are significant differences between treatment groups and the control group (NS) at 0.05, 0.01 and 0.001 levels at the same time, respectively (t test)

    图  3   尖孢镰刀菌对线虫体长的影响

    “**”和“***”分别表示相同时间内不同处理组间在0.01和0.001水平差异显著(t检验)

    Figure  3.   Effect of Fusarium oxysporum on nematode body length

    “**” and “***” indicate that there are significant differences among different treatment groups at 0.01 and 0.001 levels at the same time, respectively (t test)

    图  4   线虫分别在无孢子(NS)、灭活孢子(IS)及活性孢子(AS)组共培养不同时间的体长

    Figure  4.   Body length of nematodes in NS, IS and AS groups at different time of cocultrue

    图  5   尖孢镰刀菌对线虫繁殖的影响

    “*”和“**”分别表示相同时间内不同处理组间在0.05和0.01水平差异显著(t检验)

    Figure  5.   Effects of Fusarium oxysporum on fecundity in Caenorhabditis elegans

    “*” and “**” indicate that there are significant differences among different treatment groups at 0.05 and 0.01 levels at the same time, respectively (t test)

    图  6   尖孢镰刀菌对线虫咽泵运动速率的影响

    Figure  6.   Effect of Fusarium oxysporum on pharyngeal pumping rate of nematodes

    图  7   尖孢镰刀菌对线虫运动能力的影响

    Figure  7.   Effects of Fusarium oxysporum on locomotor ability of nematodes

    图  8   尖孢镰刀菌毒素对秀丽隐杆线虫生理特征的影响

    Figure  8.   Effects of Fusarium oxysporum toxin on the physiological characteristics of Caenorhabditis elegans

    图  9   差异基因散点图(a、b)和韦恩图(c)

    Figure  9.   Differential gene scatter plot (a, b) and Venn diagram (c)

    图  10   活性孢子 (Active spores, AS)组和无孢子 (No spore, NS)组差异基因的GO功能注释

    Figure  10.   GO function annotation of differential genes in AS and NS groups

    图  11   灭活孢子(Inactive spores, IS)组和无孢子(No spore, NS)组差异基因的GO功能注释

    Figure  11.   GO function annotation of differential genes in IS and NS groups

    图  12   活性孢子(Active spores, AS)组、无孢子(No spore, NS)组和灭活孢子(Inactive spores, IS)组差异基因KEGG通路富集柱状图

    Figure  12.   KEGG pathway enrichment histogram of differential genes of AS, NS and IS groups

  • [1]

    POULIN R, KEENEY D B. Host specificity under molecular and experimental scrutiny[J]. Trends in Parasitology, 2008, 24(1): 24-28. doi: 10.1016/j.pt.2007.10.002

    [2]

    SCHULZE-LEFERT P, PANSTRUGA R. A molecular evolutionary concept connecting nonhost resistance, pathogen host range, and pathogen speciation[J]. Trends in Plant Science, 2011, 16(3): 117-125. doi: 10.1016/j.tplants.2011.01.001

    [3]

    THINES M. An evolutionary framework for host shifts - jumping ships for survival[J]. New Phytologist, 2019, 224(2): 605-617. doi: 10.1111/nph.16092

    [4]

    JIANPING X. Assessing global fungal threats to humans[J]. mLife, 2022, 1(3): 223-240. doi: 10.1002/mlf2.12036

    [5]

    FIGTREE M, WEEKS K, CHAN L, et al. Colletotrichum gloeosporioides sensu lato causing deep soft tissue mycosis following a penetrating injury[J]. Medical Mycology Case Reports, 2013, 2: 40-43. doi: 10.1016/j.mmcr.2013.01.003

    [6] 杜宾. 镰刀菌的分类和研究现状[J]. 太原学院学报(自然科学版), 2017, 35(4): 68-70.
    [7] 叶旭红, 林先贵, 王一明. 尖孢镰刀菌致病相关因子及其分子生物学研究进展[J]. 应用与环境生物学报, 2011, 17(5): 759-762.
    [8]

    NÜRNBERGER T, BRUNNER F, KEMMERLING B, et al. Innate immunity in plants and animals: Striking similarities and obvious differences[J]. Immunological Reviews, 2004, 198(1): 249-266. doi: 10.1111/j.0105-2896.2004.0119.x

    [9]

    DARDICK C, RONALD P. Plant and animal pathogen recognition receptors signal through non-RD kinases[J]. PLoS Pathogens, 2006, 2(1): e2. doi: 10.1371/journal.ppat.0020002.

    [10]

    AUSUBEL F M. Are innate immune signaling pathways in plants and animals conserved?[J]. Nature Immunology, 2005, 6(10): 973-979. doi: 10.1038/ni1253

    [11] 郭军英. 关于血球计数板的使用及注意事项[J]. 教学仪器与实验, 2009, 25(4): 26-28.
    [12] 樊金华, 薛皎亮, 谢映平, 等. 布氏白僵菌液体培养条件的优化研究[J]. 山西大学学报(自然科学版), 2013, 36(2): 271-274.
    [13]

    STIERNAGLE T. Maintenance of C. elegans[J]. WormBook, 2006: 1-11. doi: 10.1895/wormbook.1.101.1

    [14] 台莲梅, 许艳丽, 高凤昌. 尖孢镰刀菌毒素的初步研究[J]. 黑龙江八一农垦大学学报, 2004, 16(4): 9-12.
    [15] 周鸿媛, 唐莉莉, 路勇, 等. 脱氧雪腐镰刀菌烯醇、黄曲霉毒素B1和玉米赤霉烯酮对秀丽隐杆线虫的联合毒性研究[J]. 生态毒理学报, 2018, 13(3): 112-121.
    [16] 迟东泽, 何源, 刘芳芳, 等. 鹿鞭醇提物对秀丽隐杆线虫衰老的影响[J]. 食品工业科技, 2021, 42(10): 327-335.
    [17]

    YANG J, WAN Q L, MU Q Z, et al. The lifespan-promoting effect of otophylloside B in Caenorhabditis elegans[J]. Natural Products and Bioprospecting, 2015, 5(4): 177-183. doi: 10.1007/s13659-015-0064-4

    [18]

    PUKKILA-WORLEY R, AUSUBEL F M, MYLONAKIS E. Candida albicans infection of Caenorhabditis elegans induces antifungal immune defenses [J]. PLoS Pathogens, 2011, 7(6): e1002074. doi: 10.1371/journal.ppat.1002074.

    [19] 肖月, 易杏盈, 张东华, 等. 胶孢炭疽菌侵染秀丽隐杆线虫的特性研究[J]. 生物学杂志, 2023, 40(5): 24-28.
    [20] 郭倩楠, 周正富, 徐玉泉, 等. 圆锥掘氏梅里霉侵染秀丽隐杆线虫周期的扫描电镜观察[J]. 中国农业科技导报, 2015, 17(2): 81-86.
    [21]

    HUANG X, LI D, XI L, et al. Caenorhabditis elegans: A simple nematode infection model for Penicillium marneffei[J]. PLoS One, 2014, 9(9): e108764. doi: 10.1371/journal.pone.0108764.

    [22]

    OKOLI I, BIGNELL E M. Caenorhabditis elegans: Aspergillus fumigatus (nematode-mould) model for study of fungal pathogenesis[J]. British Microbiology Research Journal, 2015, 7(2): 93-99. doi: 10.9734/BMRJ/2015/15838

    [23]

    ARNONI M V, PAULA C R, AULER M E, et al. Infections caused by Fusarium species in pediatric cancer patients and review of published literature[J]. Mycopathologia, 2018, 183(6): 941-949. doi: 10.1007/s11046-018-0257-6

    [24] 郭亦晨. 霉变槟榔中霉菌分离、鉴定及其对秀丽隐杆线虫的影响[D]. 长沙: 湖南农业大学, 2020.
  • 期刊类型引用(2)

    1. Yu Gao,Ruier Zeng,Suzhe Yao,Ying Wang,Jianguo Wang,Shubo Wan,Wei Hu,Tingting Chen,Lei Zhang. Magnesium fertilizer application increases peanut growth and pod yield under reduced nitrogen application in southern China. The Crop Journal. 2024(03): 915-926 . 必应学术
    2. 黄丽,刘兴淋,胡秋玲,何珊,邓淑焜,王海苗. 幼苗期不同花生品种的耐渍性评价. 广西师范大学学报(自然科学版). 2024(05): 184-192 . 百度学术

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出版历程
  • 收稿日期:  2023-08-11
  • 网络出版日期:  2024-02-25
  • 发布日期:  2024-02-26
  • 刊出日期:  2024-05-09

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