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广东省鸭疫里默氏杆菌流行病学监测及遗传进化关系

吴彩艳, 廖申权, 戚南山, 廖晓萍, 孙阮洋, 方亮星, 周宇峰, 李林林, 孙铭飞

吴彩艳, 廖申权, 戚南山, 等. 广东省鸭疫里默氏杆菌流行病学监测及遗传进化关系[J]. 华南农业大学学报, 2022, 43(2): 1-10. DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.202105022
引用本文: 吴彩艳, 廖申权, 戚南山, 等. 广东省鸭疫里默氏杆菌流行病学监测及遗传进化关系[J]. 华南农业大学学报, 2022, 43(2): 1-10. DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.202105022
WU Caiyan, LIAO Shenquan, QI Nanshan, et al. Epidemiological surveillance and genetic evolution of Riemerella anatipestifer in Guangdong Province[J]. Journal of South China Agricultural University, 2022, 43(2): 1-10. DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.202105022
Citation: WU Caiyan, LIAO Shenquan, QI Nanshan, et al. Epidemiological surveillance and genetic evolution of Riemerella anatipestifer in Guangdong Province[J]. Journal of South China Agricultural University, 2022, 43(2): 1-10. DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.202105022

广东省鸭疫里默氏杆菌流行病学监测及遗传进化关系

基金项目: 广东省基础与应用基础研究基金(2019A1515010913);广东省自然科学基金温氏集团联合基金重点项目(2018B030315002)
详细信息
    作者简介:

    吴彩艳,研究员,博士研究生,主要从事禽传染病研究,E-mail: wucaiyan906@163.com

    通讯作者:

    孙铭飞,研究员,博士,主要从事禽传染病研究,E-mail: smf7810@126.com

  • 中图分类号: S83; S85

Epidemiological surveillance and genetic evolution of Riemerella anatipestifer in Guangdong Province

  • 摘要:
    目的 

    明确广东地区鸭疫里默杆菌Riemerella anatipestifer的血清型、耐药状况及遗传进化关系。

    方法 

    从规模化鸭场分离鉴定鸭疫里默氏杆菌,通过玻片凝集试验鉴定血清型;利用试管两倍稀释法测试抗菌药物的最低抑菌浓度,分析药物的敏感性;采用全基因组测序技术分析序列特征并构建核心基因组遗传进化树。

    结果 

    共分离鉴定鸭疫里默氏杆菌168株,血清1、2、3、5、6、7、8、10型均有流行,血清1型的菌株高达54.17% (91/168),其次为2型,占27.97%(47/168)。48株代表性菌株对庆大霉素、卡那霉素、盐酸环丙沙星表现高度耐药,耐药率均超过80%;对土霉素、盐酸四环素、盐酸金霉素、氧氟沙星、诺氟沙星、磺胺二甲嘧啶、磺胺对甲氧嘧啶的耐药率均在60%以上;对阿莫西林、头孢噻肟和大观霉素的耐药率低于30%。受试菌株对5~12种药物耐药,共有44种耐药谱型。成功获得46株菌株全基因组序列,共检出6种耐药基因,其中,耐药基因erm(F)和tet(X)的检出率较高,分别为73.91%(34/46)和82.60%(38/46),同时携带2种以上耐药基因的菌株占95.65%(44/46)。18株(39.13%,18/46)菌株ST分型成功,分属11个ST型。所有测序菌株与数据库中来自中国的菌株在遗传进化关系上最接近,主要存在于优势克隆群系Clade 1和Clade 3中。

    结论 

    本研究鸭疫里默氏杆菌分离株的优势血清型为1型,耐药性严重,所携带的耐药基因与耐药表型具有一定相关性,ST型呈多样性,与多位点序列分型(Multi-locus sequence typing, MLST)数据库中来自我国菌株的遗传背景相近。研究结果可为鸭疫里默氏杆菌病疫苗免疫预防与药物治疗提供依据,有助于掌握鸭疫里默氏杆菌遗传进化特征。

    Abstract:
    Objective 

    To clarify serotype, drug resistance and genetic evolution of Rimerella anatipestifer in Guangdong.

    Method 

    The isolates of R. anatipestifer were isolated and identified from samples of the large-scale duck farms. Serotype was identified by glass agglutination test. The minimum inhibitory concentration was tested by double dilution method in test tube, and the drug sensitivity was analyzed. Whole genome sequencing technology was used to analyze the sequence characteristices and construct the genetic evolution tree of the core genome.

    Result 

    A total of 168 isolates of R. anatipestifer were isolated and identified. All serotype 1, 2, 3, 5, 6, 7, 8 and 10 were prevalent. Serotype 1 was dominant, reaching 54.17%(91/168), followed by serotype 2 (27.97%, 47/168). The 48 representative isolates were used for drug sensitivty test and sequence analysis. The isolates showed high drug resistance to gentamicin, kanamycin and ciprofloxacin hydrochloride, and the drug resistance rates were all more than 80%. The drug resistance rates to oxytetracycline, tetracycline hydrochloride, chlortetracycline hydrochloride, ofloxacin, norfloxacin, sulfadimidine and sulfamethoxydiazine were all more than 60%, and the drug resistance rates to amoxicillin, cefotaxime and spectinomycin were all less than 30%. The 48 representative isolates were resistant to 5−12 kinds of drugs, and there were 44 types of drug resistance spectrum. The whole genome sequences of 46 isolates were obtained successfully, and six drug-resistant genes were detected. The detection rates of drug-resistant geneserm(F) and tet(X) were 73.91% (34/46) and 82.60% (38/46), respectively. In addition, 95.65% (44/46) of the isolates carried more than two drug-resistant genes at the same time. Total 18 isolates (39.13%, 18/46) were typed successfully with 11 kinds of ST. Further genetic tree construction based on the core genome showed that all the sequenced isolates had a high similarity with the isolates from China in the multi-locus sequence typing (MLST) database, and mainly existed in the dominant clones of Clade 1 and Clade 3.

    Conclusion 

    Serotype 1 is superior in the investigated R. anatipestifer isolates, and the drug resistance is serious. The drug-resistant genes and resistant phenotype have certain relevance. ST type has a high diversity. The genetic background of tested strains was similar with Chinese strains in MLST database. The results of this study can provide a basis for vaccine immunity prevention and drug therapy of R. anatipestife disease as well as for understanding the genetic evolution characteristics of R. anatipestife.

  • 直流电机具有起动转矩大、制动性能好、调速平滑且调速范围宽、过载能力强、清洁环保等优良特性,被广泛应用于工农业生产的各个领域[1~5]。现有直流电机驱动的研究中,最常见的就是基于PWM的H型全桥驱动电路,这种驱动方式具有快速、精确、高效、低功耗等特点[6-10],但在大功率电机应用场合,MOSFET过流很大,高达几十安,电路发热严重,不适合长时间工作。病死猪搬运车采用2台较大功率永磁有刷直流电机驱动,需要低速大转矩驱动,电机启动电流大,目前还没有商业化的专用驱动系统。本研究结合病死猪搬运车所用的永磁有刷直流电机底盘驱动需求,设计了用于病死猪搬运车的底盘驱动控制系统并开展了试验研究,为解决病死猪搬运车的大功率永磁有刷直流电机驱动控制问题提供一种方案。

    系统总体框图如图1所示。以单片机STM32F103ZET6为主控制器,将产生的脉宽调制(PWM)信号和方向控制信号(DIR)通过信号线传输至电机驱动电路[11]。电机驱动电路分为功率驱动电路和继电器驱动电路。PWM信号经过光电耦合芯片TLP250后,多个MOS管的栅极并联连接TLP250的输出,由TLP250驱动MOS管,构成功率驱动电路;方向控制信号经逻辑运算后产生新的控制信号,通过继电器驱动电路分别控制2组继电器的关断,从而控制电机的正转或反转[12]。稳压供电电路为整个电机驱动系统提供所需电压。由于所用电机工作电流较大,大电流的冲击很容易烧坏芯片,因此设计过流保护电路很有必要,当电机电流超出设定值时,通过过流保护电路使继电器失电停止工作,电机停转[13]。利用LM358设计电流检测和反馈电路,通过闭环反馈稳定电机工作电流,当电流过大时,反馈信号和PWM信号经逻辑运算后产生的信号使继电器关断,从而保护整个驱动电路[13-17]

    图  1  驱动控制系统框图
    Figure  1.  The schematic diagram of drive control system

    硬件电路是控制系统的重要组成部分,是实现系统控制目的的载体。本驱动控制系统的硬件电路主要包括功率驱动电路、继电器驱动电路、稳压供电电路、电流采样与转换电路以及过流保护电路。

    在功率驱动电路中,采用光耦芯片TLP250经三极管放大后驱动8个MOS管IRF3205,多个MOS管并联起到分流作用,查看IRF3205的芯片资料可以知道,该芯片在25 ℃下,最大漏源极电压(耐压)UDSS=55 V、持续漏极电流ID=110 A。对于大功率永磁有刷直流电机,单个MOS管的持续电流虽满足要求,但在实际工作中要留3~4倍的余量,且随着电流的增大,MOS管发热,内阻也随之增大,影响持续漏极电流,因此采用多颗MOS管并联的方式来分流。功率驱动电路如图2所示。图2中,R1、R3、…、R15为栅极驱动电阻,每个MOS管都由独立的栅极驱动电阻隔离驱动,可以防止各个MOS管的寄生振荡,起到阻尼作用;R2、R4、…、R16是栅极下拉电阻,主要作用是在驱动芯片损坏开路的情况下防止MOS管误导通。采用多个MOS管并联的方式,漏极和源极的走线要通过多个MOS管的电流,要求其总线上的阻抗控制在所有MOS管并联后的内阻的10%以内。理论上计算,单个MOS管的电流偏移不能超过平均电流的10%。IRF3205的内阻为8 mΩ,因此总线上的电阻不能超过1 mΩ。

    图  2  功率驱动电路图
    Figure  2.  The circuit diagram of power drive

    继电器是用小电流控制大电流的开关器件,具有驱动简单、动作迅速可靠、维护方便、使用寿命长等特点,适用于低频率开关场合。本文采用2个JD1914五脚大电流继电器,由主控制器STM32F103ZET6产生的2路方向控制信号DIR1和DIR2,经大电流驱动阵列芯片ULN2003,ULN2003可产生高达500 mA的电流驱动三极管导通,从而驱动控制2个继电器的导通与关断。继电器驱动电路图如图3所示,当继电器K1动作时,常开触点吸合,常闭触点断开,电机反转;当继电器K2动作时,电机正转;当K1和K2的常开触点同时吸合或常闭触点同时吸合时,电机不工作。

    图  3  继电器驱动电路图
    Figure  3.  The circuit diagram of relay drive

    整个系统由2块12 V的铅酸电池并联提供24 V工作电压,由于3个器件TLP250、JD1914和ULN2003分别需要18、12和5 V电压供电,为此,本系统采用LM7918、LM7812和LM7805这3个三端稳压集成电路芯片,分别为其提供所需电压。在每个稳压芯片的输出端并联1只0.1 μF的滤波电容,能有效滤除低频杂波。由于稳压芯片内阻的存在,输入、输出两端存在电压差,在稳压芯片工作电流的作用下,芯片发热,因此需要加装散热片,以增加散热。这3种芯片均采用TO-220封装,其引脚图如图4所示。

    图  4  TO-220封装引脚图
    Figure  4.  Pin diagram of TO-220 encapsulation

    电流反馈控制框图如图5所示。在电流采样与控制电路中,采用霍尔电流传感器ACS758LCB-050B-PFF-T电流采样芯片,其量程为50 A,可供大电流采样电路使用,满足该驱动控制系统的电流采样需求。电流采样后的输出信号经模拟信号隔离器HCNR200隔离输出,然后通过由LM358构成的电压跟随器,最后输出采样信号,该信号传递到主控制器,主控制器根据电流调节算法,调节输出的PWM占空比,进而调节电机的工作电流,形成电流闭环。电流闭环反馈的目的是调节电机转速、引入电流闭环,有助于提高搬运车的运行稳定性。

    图  5  电流反馈控制框图
    Figure  5.  The block diagram of current feedback control

    在过流保护电路中,利用运放LM358及部分电阻、电容构建差分运放电路,采用3个直径为1.2 mm、长度为10 cm的康铜丝并联,作为电流采样电阻,并联后电阻为0.014 Ω。当电流超过设定的最大安全电流值时,运算放大器的输出信号和控制电机的方向信号经过逻辑电路运算和ULN2003放大后,作用于2个继电器,使2个继电器的常开触点同时吸合,电机两端电压为0,电机失电停止工作。

    以单片机STM32F103为主控制器,上位机编写的控制算法通过主控制器的通信串口USB_232写入,主控制器对控制算法进行解算。主控制器产生2路PWM信号和4路方向控制信号,分别控制2个直流有刷电机的运行。PWM1、DIR1和DIR2控制电机1,PWM2、DIR3和DIR4控制电机2。

    电机在启动时所需克服的阻力要大于正常运行时的阻力,在启动时,电机要提供足够的转矩才能使电机正常启动。因所设计的病死猪搬运车要承受很大的负荷,车子启动需要克服很大的摩擦阻力,车子在正常行驶时,车轮所受阻力矩(M)为:

    $$M = {\mu _{\rm{k}}}{F_{\rm{N}}},$$ (1)

    式中, ${\mu _{\rm{k}}}$ 为有量纲的滚动摩擦系数, 根据有关资料,充气轮胎与泥土路的有量纲的滚动摩擦系数最大值为1.5×10–3 ${F_{\rm{N}}}$ 是法向量压力,已知搬运车质量(m)150 kg,吊升病死猪只的最大质量(m猪max)设定300 kg,单个轮子受力按最大计,单个轮子受力为:

    $${F_{{\rm{N}}\max }} = {\rm{g}}{m_{{\text{车}}}} + {\rm{g}}{m_{{\text{猪}}\max}} \approx 4.5 \times {10^3},$$ (2)

    式中,g为重力加速度,取g=10 m/s2。计算可得:

    $${M_{\max }}=6.75\text{。}$$ (3)

    电机额定电压24 V,额定功率1.1 kW,额定转速1 500 r/min,已知:

    $$P = F {{{V}}_{{\rm{max}}}},$$ (4)
    $$T = FR,$$ (5)
    $$F = \frac{T}{{{R}}},$$ (6)
    $${{{V}}_{{\rm{max}}}} = 2{\rm{\pi }}R {{n}}\text{。}$$ (7)

    由公式(4)~(7)可得:

    $$P = F {{{V}}_{\max }} = \frac{{\rm{\pi }}}{{30}}T {{n}}\text{。}$$ (8)

    公式(4)~(8)中,P为功率,F为拉力,Vmax为最大线速度,T为电机输出转矩,R为作用半径,n为电机额定转速。由于电机和车轮之间连有蜗轮蜗杆减速器,其减速比为7.5∶1.0,计算可得电机实际输出转矩最大值 $\left({{{T}}_{{\rm{max}}}}\right)$

    $${{{T}}_{{\rm{max}}}} \approx 52.52\text{。}$$ (9)

    当搬运车满负荷运行时,其启动转矩势必非常大,考虑到搬运车由四轮承力、双电机驱动,车轮所受摩擦阻力并没那么大。因此,在启动时,两路PWM占空比设定为35%,当检测到车子启动时,迅速将占空比梯度降低到设定值。

    对搬运车驱动控制系统的硬件和软件设计进行试验验证,主要验证该驱动控制系统的启动性能、调速性能以及保持直线行驶的性能。

    在试验时对驱动控制系统的输出进行数据采集,调节单片机输出PWM的占空比,用示波器测量驱动器输出波形的变化情况,并适时测量驱动器的输出电流。试验测得该车在直线行驶时在前进运行状态下,电机的工作电流随PWM占空比变化情况见表1。由表1可知,向前行驶时,从0调节单片机输出PWM的占空比,占空比达到6.8%左右时,克服电机启动时的阻力矩,电机开始启动,此时电机转速很小,不足以正常地启动行驶。占空比的小幅增长即可使电机的工作电流快速增大,电机转速随之快速增大,调节占空比至16%以后,电机工作电流随占空比增大呈现线性增长趋势。试验表明,占空比为16%时搬运车空载启动性能较好,基本实现了稳定平滑启动的功能而没有出现大电流冲击等状况,利于启动后线性调速。此时电机驱动器输出端输出波形是一个幅值为24.6 V、频率为16.7 kHz、周期为60 μs、占空比为16%的方波(图6),与单片机此时输出的PWM信号周期、频率及占空比完全一致。表1的数据表明:在占空比为16%~94%的区间内,电机工作电流随占空比的增加呈线性增大,电机转速也随之越来越快,转速从稳定启动后的低转速至满转,调节范围大,调速效果较好,基本实现了预定的调速性能。

    表  1  搬运车前进方向空载试验结果
    Table  1.  The results of no-load test of vehicle in the moving direction
    左轮电机 Left-wheel motor 右轮电机 Right-wheel motor
    占空比/%
    Duty ratio
    I/A 占空比/%
    Duty ratio
    I/A
    0 0 0 0
    5.7 0 5.4 0
    6.8 0.32 6.9 0.33
    8.1 1.26 8.5 1.34
    11.8 4.97 11.8 5.07
    13.4 5.85 13.7 6.24
    16.0 7.41 20.0 8.74
    21.3 8.72 28.4 10.31
    26.7 10.09 35.6 10.96
    33.3 10.94 45.3 11.90
    38.7 11.21 58.1 12.40
    44.0 11.63 68.9 13.10
    54.1 12.11 74.5 13.56
    60.0 12.55 82.3 13.88
    68.0 12.87 93.9 14.26
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    图  6  空载启动驱动电路输出
    Figure  6.  Circuit output driven by no-load start

    试验测得该车在倒车行驶时,电机的工作电流随PWM占空比变化情况见表2。向后行驶时,启动与调速的状况与向前行驶时类似,由于搬运车整体重心在车的前半部分,前轮受力大,后轮受力较小,因此在启动和行驶过程中,电机克服的阻力矩较向前时要小。表2的试验结果也表明,向后行驶时,占空比在12%左右就能稳定平滑启动,比向前行驶时稳定启动所需的占空比要小,在占空比为12%~95%的区间内电机转速线性可调。

    表  2  搬运车倒车方向空载试验
    Table  2.  The results of no-load test of vehicle in the reversing direction
    左轮电机 Left-wheel motor 右轮电机 Right-wheel motor
    占空比/%
    Duty ratio
    I/A 占空比/%
    Duty ratio
    I/A
    0 0 0 0
    5.4 0 5.6 0
    6.7 0.32 6.8 0.32
    8.1 1.20 8.3 1.24
    11.8 5.05 11.8 4.94
    12.2 5.40 12.7 5.51
    22.1 6.88 22.7 6.94
    26.8 7.85 32.2 8.20
    33.3 8.28 40.9 8.89
    37.3 8.57 46.3 9.37
    44.0 9.39 54.4 9.61
    48.4 9.48 63.8 10.10
    55.0 9.88 70.7 10.25
    65.8 10.23 81.2 10.51
    82.4 10.58 95.9 10.74
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    利用Microsoft Excel数据处理软件对表1表2的数据进行曲线拟合,拟合曲线如图7所示。图7中所示的4条曲线分别是左轮电机前进方向、右轮电机前进方向、左轮电机倒车方向和右轮电机倒车方向。分析对比图7中的4条曲线,在平滑路况下,该车直线行驶过程中,无论前进或倒车,该车的2个驱动电机都有较好的双机协调运转性能,保证该车直线行驶过程中在没外界强力干扰时能够稳定地直线行驶。

    图  7  电机前后行驶占空比与电流拟合曲线
    Figure  7.  The fitting curve of duty ratio and current of motor driving forward or backward

    该文所设计的病死猪搬运车底盘驱动控制系统驱动功率大、启动平稳,具有调速范围宽、调速平滑的优点,具有较好的双电机协调一致的运行性能和良好的过流过载能力,通过继电器和光耦的隔离作用,使驱动电路与电机及控制器隔离,有效防止驱动电路故障对电机和控制器的冲击损害,很好地实现了大功率永磁有刷直流电机的驱动与控制,实现了搬运车的基本行驶功能。为解决大功率直流电机驱动问题提供一种方案,并具有稳定可靠、成本低廉、实用性强的优点,便于推广使用。

  • 图  1   鸭疫里默氏杆菌分离株PCR鉴定结果

    M:DNA标准DL2000;1、2:鸭疫里默氏杆菌分离株;3:阳性对照;4:阴性对照

    Figure  1.   PCR identification results of Riemerella anatipestifer isolates

    M: DNA marker DL2000; 1, 2: Riemerella anatipestifer isolates; 3: Positive control; 4: Negative control

    图  2   48株鸭疫里默氏杆菌代表性分离株多重耐药性分布

    Figure  2.   Results of multi-drug resistance of 48 Riemerella anatipestifer representative isolates

    图  3   105株鸭疫里默氏杆菌菌株核心基因组系统进化树

    Figure  3.   Phylogenetic tree of core genomes for 105 isolates of Riemerella anatipestifer

    表  1   采集样本与分离鸭疫里默氏杆菌信息

    Table  1   Collected samples and isolation information of Riemerella anatipestifer

    地区
    District
    采集时间
    Acquisition time
    养殖场数
    Farm number
    样本数
    Sample number
    分离株数
    Isolate number
    代表性株数
    Representative isolate number
    韶关 Shaoguan 2015−05—2019−04 19 69 15 5
    河源 Heyuan 2015−07—2019−11 16 56 13 5
    云浮 Yunfu 2015−09—2019−12 30 112 25 4
    肇庆 Zhaoqing 2015−04—2019−10 17 63 12 4
    清远 Qingyuan 2015−03—2019−12 23 91 19 5
    佛山 Foshan 2015−05—2019−12 15 57 12 5
    茂名 Maoming 2015−04—2019−11 20 80 16 5
    惠州 Huizhou 2015−05—2019−11 23 80 17 5
    汕头 Shantou 2015−03—2019−12 25 91 21 5
    湛江 Zhanjiang 2015−05—2019−12 22 82 18 5
    总计 Total 2015—2019 210 781 168 48
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    表  2   各地区各血清型鸭疫里默氏杆菌分离株数量

    Table  2   Isolate number of each serotype for Riemerella anatipestifer isolates from different districts

    地区
    District
    分离株数
    Isolate number
    血清型 Serotype
    1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 未定型 Undefined
    韶关 Shaoguan 15 7 2 2 0 0 1 0 1 0 0 2
    河源 Heyuan 13 7 4 1 0 0 0 0 0 0 1 0
    云浮 Yunfu 25 15 8 0 0 1 0 0 0 0 0 1
    肇庆 Zhaoqing 12 6 3 1 0 0 0 0 1 0 1 0
    清远 Qingyuan 19 10 6 1 0 1 0 0 0 0 0 1
    佛山 Foshan 12 7 4 0 0 0 0 1 0 0 0 0
    茂名 Maoming 16 8 5 1 0 0 0 0 1 0 1 0
    惠州 Huizhou 17 12 3 0 0 0 0 1 0 0 1 0
    汕头 Shantou 21 12 7 0 0 0 0 0 0 0 2 0
    湛江 Zhanjiang 18 7 5 0 0 1 1 1 2 0 0 1
    总计 Total 168 91 47 6 0 3 2 3 5 0 6 5
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    表  3   48株鸭疫里默氏杆菌代表性分离株最低抑菌浓度(MIC)测定结果1)

    Table  3   The minimum inhibitory concentration (MIC) of 48 representative isolates of Riemerella anatipestifer

    药物类型
    Drug type
    药物1)
    Drug
    MIC/
    (mg·L−1)
    MIC50/
    (mg·L−1)
    MIC90/
    (mg·L−1)
    占比/% Proportion
    敏感
    Sensitive
    中介
    Intermediate
    耐药
    Resistant
    β−内酰胺类 AMX <0.125~256 1 128 75.00(36/48) 6.25(3/48) 18.75(9/48)
    β-lactams AMP <0.125~256 8 128 64.58(31/48) 35.42(17/48)
    CTX <0.125~256 0.25 8 91.67(44/48) 4.17(2/48) 4.17(2/48)
    四环素类 OXY <0.125~128 8 16 20.83(10/48) 14.58(7/48) 64.58(31/48)
    Tetracyclines TCY <0.125~128 8 32 18.75(9/48) 10.42(5/48) 70.83(34/48)
    CTE <0.125~32 8 16 18.75(9/48) 20.83(10/48) 60.42(29/48)
    氨基糖苷类 GEN 0.25~>256 128 >256 8.33(4/48) 91.67(44/48)
    Aminoglycosides KAN 2~>256 >256 >256 8.33(4/48) 2.08(1/48) 89.58(43/48)
    STP 16~256 64 128 45.83(22/48) 25.00(12/48) 29.17(14/48)
    喹诺酮类 OFX 0.5~64 8 32 20.83(10/48) 6.25(3/48) 72.92(35/48)
    Quinolones NOR 0.25~128 32 64 14.58(7/48) 16.67(8/48) 68.75(33/48)
    CIP 0.5~64 16 32 14.58(7/48) 4.17(2/48) 81.25(39/48)
    磺胺类 SDI 64~>256 256 >256 52.08(25/48) 47.92(23/48)
    Sulfonamides SUL 32~>256 >256 >256 39.58(19/48) 60.42(29/48)
    SMD 128~>256 >256 >256 33.33(16/48) 66.67(32/48)
     1)AMX:阿莫西林,AMP:氨苄西林,CTX:头孢噻肟,OXY:土霉素,TCY:盐酸四环素,CTE:盐酸金霉素,GEN:庆大霉素,KAN:卡那霉素,STP:大观霉素,OFX:氧氟沙星,NOR:诺氟沙星,CIP:盐酸环丙沙星,SDI:磺胺嘧啶,SUL:磺胺二甲嘧啶,SMD:磺胺对甲氧嘧啶;MIC50和MIC90为能抑制50%和90%细菌生长所需的MIC;“—”表示未检测出菌株
     1) AMX: Amoxicillin, AMP: Ampicillin, CTX: Cefotaxime, OXY: Oxytetracycline, TCY: Tetracycline hydrochloride, CTE: Chlortetracycline hydrochloride, GEN: Gentamicin, KAN: Kanamycin, STP: Spectinomycin, OFX: Ofloxacin, NOR: Norfloxacin, CIP: Ciprofloxacin hydrochloride, SDI: Sulfadiazine, SUL: Sulfadimidine, SMD: Sulfametoxydiazine; MIC50 and MIC90 are MIC values that can inhibit 50% and 90% bacteria growth; “—” indicates no detectable isolate
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    表  4   48株鸭疫里默氏杆菌代表性分离株耐药谱统计结果

    Table  4   Drug resistance spectrum of 48 representative isolates of Riemerella anatipestifer

    药物数量
    Drug number
    耐药谱1)
    Resistant spectrum
    菌株数
    Isolate number
    占比/%
    Proportion
    5 OFX-NOR-OXY-GEN-KAN
    OFX-CTE-GEN-CIP-KAN
    1
    1
    2.08
    2.08
    6 OFX-NOR-TCY-GEN-CIP-KAN
    OFX-NOR-GEN-CIP-KAN-SMD
    NOR-GEN-CIP-KAN-SUL-SMD
    CIP-KAN-STP-SUL-SMD-SDI
    1
    1
    1
    1
    2.08
    2.08
    2.08
    2.08
    7 OXY-TCY-CTE-GEN-KAN-SUL-NOR
    OXY-GEN-KAN-SDI-SUL-SMD-CIP
    OXY-TCY-CTE-GEN-KAN-OFX-CIP
    OXY-TCY-CTE-GEN-KAN-NOR-CIP
    1
    1
    1
    2
    2.08
    2.08
    2.08
    4.16
    8 OFX-NOR-TCY-CTE-GEN-CIP-SUL-SMD
    NOR-TCY-CTE-GEN-CIP-KAN-SDI-SMD
    CIP-GEN-SDI-SUL-SMD-NOR-TCY-AMP
    AMX-AMP-OXY-TCY-CTE-GEN-KAN-OFX
    AMP-STP-SDI-SUL-SMD-GEN-KAN-OXY
    1
    1
    1
    1
    1
    2.08
    2.08
    2.08
    2.08
    2.08
    9 OFX-NOR-TCY-OXY-CTE-GEN-CIP-KAN-SUL
    OFX-NOR-TCY-CIP-KAN-SDI-SUL-SMD-GEN
    OFX-NOR-AMX-CTE-GEN-CIP-KAN-SUL-SMD
    OXY-TCY-GEN-KAN-OFX-NOR-CIP-SDI-SUL
    TCY-GEN-CIP-KAN-SDI-SMD-CTE-OFX-SUL
    OXY-AMP-GEN-KAN-STP-SDI-SUL-SMD-NOR
    OFX-NOR-OXY-GEN-CIP-KAN-SUL-SMD-SMD
    OFX-TCY-OXY-GEN-KAN-STP-SDI-SUL-SMD
    AMP-CTX-SDI-GEN-SMD-OFX-STP-KAN-CIP
    AMX-AMP-OXY-TCY-STP-KAN-OFX-SDI-GEN
    SMD-ERY-OFX-SDI-CIP-AMX-AMP-CTE-TCY
    NOR-TCY-OXY-CTE-GEN-CIP-KAN-SUL-AMP
    2
    1
    1
    2
    1
    1
    1
    1
    1
    1
    1
    1
    4.16
    2.08
    2.08
    4.16
    2.08
    2.08
    2.08
    2.08
    2.08
    2.08
    2.08
    2.08
    10 NOR-TCY-OXY-CTE-GEN-CIP-KAN-STP -SMD-SDI
    AMP-OXY-TCY-CTE-GEN-KAN-OFX-NOR-CIP-SMD
    OFX-NOR-TCY-CTE-GEN-CIP-KAN-SDI-SMD-SUL
    OFX-NOR-TCY-OXY-CTE-GEN-CIP-KAN-SMD-SDI
    OFX-NOR-AMX-AMP-GEN-CIP-KAN-SUL-SMD-CTE
    OFX-NOR-TCY-AMX-OXY-CTE-GEN-CIP-KAN-SDI
    OFX-NOR-TCY-OXY-CTE-GEN-CIP-KAN-SUL-SMD
    TCY-AMP-GEN-CIP-KAN-STP-SDI-SUL-SMD-KAN
    AMX-AMP-OXY-TCY-CTE-GEN-KAN-OFX-SDI-SUL
    OFX-NOR-OXY-CTE-AMP-GEN-CIP-KAN-SUL-SMD
    OFX-NOR-AMX-AMP-GEN-CIP-KAN-SDI-SMD-STP
    TCY-OXY-GEN-KAN-STP-SDI-SUL-SMD-CTX-AMP
    1
    1
    1
    1
    1
    1
    1
    1
    1
    1
    1
    1
    2.08
    2.08
    2.08
    2.08
    2.08
    2.08
    2.08
    2.08
    2.08
    2.08
    2.08
    2.08
    11 OFX-NOR-TCY-CTE-OXY-GEN-CIP-KAN-STP-SDI-SMD
    OFX-NOR-TCY-OXY-CTE-AMP-GEN-CIP-KAN-STP-SUL
    OFX-NOR-TCY-OXY-CTE-AMP-GEN-CIP-KAN-STP-SMD
    2
    1
    1
    4.16
    2.08
    2.08
    12 AMX-OXY-TCY-CTE-STP-KAN-OFX-NOR-SUL-SMD-SMD-CIP
    OFX-NOR-TCY-OXY-AMP-GEN-CIP-STP-SUL-SMD-SDI-CTE
    1
    1
    2.08
    2.08
     1) AMX:阿莫西林,AMP:氨苄西林,CTX:头孢噻肟,OXY:土霉素,TCY:盐酸四环素,CTE:盐酸金霉素,GEN:庆大霉素,KAN:卡那霉素,STP:大观霉素,OFX:氧氟沙星,NOR:诺氟沙星,CIP:盐酸环丙沙星,SDI:磺胺嘧啶,SUL:磺胺二甲嘧啶,SMD:磺胺对甲氧嘧啶
     1) AMX: Amoxicillin, AMP: Ampicillin, CTX: Cefotaxime, OXY: Oxytetracycline, TCY: Tetracycline hydrochloride, CTE: Chlortetracycline hydrochloride, GEN: Gentamicin, KAN: Kanamycin, STP: Spectinomycin, OFX: Ofloxacin, NOR: Norfloxacin, CIP: Ciprofloxacin hydrochloride, SDI: Sulfadiazine, SUL: Sulfadimidine, SMD: Sulfametoxydiazine
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    表  5   46株鸭疫里默氏杆菌代表性分离株耐药基因携带情况

    Table  5   The resistance genes carried by 46 Riemerella anatipestifer representative isolates

    药物
    Drug
    耐药基因
    Resistant gene
    阳性率/%
    Positive rate
    大环内酯类 erm(F) 73.91(34/46)
    Macrolides ere(D) 19.57(9/46)
    四环素类
    Tetracyclines
    tet(X) 82.60(38/46)
    氟苯尼考
    Florfenicol
    floR 30.43(14/46)
    氨基糖苷类
    Aminoglycosides
    aadS 34.78(16/46)
    β−内酰胺类 β-lactams bla OXA-209 54.35(25/46)
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图(3)  /  表(5)
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出版历程
  • 收稿日期:  2021-05-11
  • 网络出版日期:  2023-05-17
  • 刊出日期:  2022-03-09

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