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4种噬菌体对寄主青枯菌的敏感性及作用受体分析

余成鹏, 胡蓉花, 林培炯, 李杏蔚, 钟敏, 刘琼光

余成鹏, 胡蓉花, 林培炯, 等. 4种噬菌体对寄主青枯菌的敏感性及作用受体分析[J]. 华南农业大学学报, 2020, 41(2): 82-87. DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.201903022
引用本文: 余成鹏, 胡蓉花, 林培炯, 等. 4种噬菌体对寄主青枯菌的敏感性及作用受体分析[J]. 华南农业大学学报, 2020, 41(2): 82-87. DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.201903022
YU Chengpeng, HU Ronghua, LIN Peijiong, et al. Sensitivity of four phages to host bacterium Ralstonia solanacearum and analysis of their receptors[J]. Journal of South China Agricultural University, 2020, 41(2): 82-87. DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.201903022
Citation: YU Chengpeng, HU Ronghua, LIN Peijiong, et al. Sensitivity of four phages to host bacterium Ralstonia solanacearum and analysis of their receptors[J]. Journal of South China Agricultural University, 2020, 41(2): 82-87. DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.201903022

4种噬菌体对寄主青枯菌的敏感性及作用受体分析

基金项目: 江西省烟草公司科技项目(赣烟司[2016]81号)
详细信息
    作者简介:

    余成鹏(1993—),男,硕士研究生,E-mail: 1013202158@qq.com

    通讯作者:

    刘琼光(1964—),男,副教授,博士,E-mail: qgliu@scau.edu.cn

  • 中图分类号: S432.1

Sensitivity of four phages to host bacterium Ralstonia solanacearum and analysis of their receptors

  • 摘要:
    目的 

    明确不同噬菌体混合对茄劳尔氏菌(青枯菌)Ralstonia solanacearum裂解能力和对噬菌体抗性产生的影响,了解4种噬菌体的作用受体。

    方法 

    将4种噬菌体P1556-1、P1556-2、P7-1和P1521两两混合后,比较其在青枯菌平板上产生的噬菌斑大小;噬菌体与青枯菌混合培养测定青枯菌对噬菌体的抗性;通过噬菌体与脂多糖和膜蛋白的吸附试验测定噬菌体的作用受体。

    结果 

    噬菌体P1556-1产生的噬菌斑最大,裂解青枯菌的能力强。4种噬菌体两两混合产生的噬菌斑与单一噬菌体产生的噬菌斑大小没有显著差异,但可延缓抗噬菌体的青枯菌产生。噬菌体P1556-2可被青枯菌的脂多糖吸附,P1521能被脂多糖和膜蛋白吸附,而P1556-1和P7-1均不能与脂多糖和膜蛋白作用。

    结论 

    不同噬菌体混合不能提高其裂解青枯菌的能力,但可以延缓抗性青枯菌的产生;不同噬菌体作用受体不同。

    Abstract:
    Objective 

    To investigate the lysis abilities of different phages mixtures against Ralstonia solanacearum, study their effects on the generation of phage-resistant strains, and clarify the receptors of four types of phages.

    Method 

    Four types of phages, including P1556-1, P1556-2, P7-1 and P1521, were mixed in pairs. The sizes of plaques on R. solanacearum plates were determined. The resistance of R. solanacearum to phages was measured by co-culture of R. solanacearum and phages. Adsorption tests using phages, lipopolysaccharide (LPS) and membrane protein were conducted to determine the receptors of phages.

    Result 

    Phage P1556-1 produced the largest plaque, indicating a strong lytic ability against R. solanacearum. The plaque sizes from the mixtures of two types of phages did not significantly differ from those of individual phages, while mixing two types of phages could slow down the generation of phage-resistant strains. Phage P1556-2 could be adsorbed by LPS of R. solanacearum, phage P1521 could be adsorbed by both LPS and membrane protein, while phage P1556-1 and P7-1 could be adsorbed by neither LPS nor membrane protein.

    Conclusion 

    Mixing different phages can not improve the lysis ability against R. solanacearum, but can delay the generation of resistant host strain. The receptors of different phages are different.

  • 2021年广东省菜心Brassica campestris L. ssp. chinensis var. utilis Tsen et Lee (Flowering Chinese cabbage)播种面积达36万hm2,是广东省绿叶蔬菜产销排名第一的作物[1-2]。当前菜心种植基地大多采用人工经验式管理下的露地种植、大棚种植方式,露地种植容易受到恶劣天气的影响,大棚种植能够大大降低这一负面影响。然而目前菜心大棚种植依靠人工较难准确地监测种植环境信息,在菜心生长环境偏离适宜条件时无法进行及时的准确调控,导致菜心品质、产量下降。随着智慧农业的发展[3-4],通过农业传感器等智能设备[5]搭建蔬菜种植管控系统可以实现作物生长环境的远程监控和管理,而管控系统对环境调控的速度和精度是提高生产种植管理效率和质量的关键。

    目前,作物管控系统已在国外得到广泛应用,利用农业智能设备与现代计算机技术实现农业生产、农事服务的高效管理[6-11]。如美国、日本、法国等国家已建立集生态化、产业化、标准化、集约化、规模化于一体的多个示范性现代农业产业园,提升了经济和环境效益。

    近年来国内开展了一系列作物管控系统的研究[12-14],王纪章等[15]通过有线、无线传感器感知种植环境及作物对气候的反应,并做出正确的、精准的环境调控决策,建立基于物联网的灌溉施肥系统,合理分配农业生产过程中的水和肥料,提高了生产力和质量,但在环境调控性能上仍存在调控不及时、不准确的问题。姬丽雯等[16]使用轻量级的MQTT协议设计了草莓监控系统,实现了对温室环境信息的实时采集和远程控制,但未涉及智能调控功能,无法给予农户专业指导。杨伟志等[17]基于土壤水分等相关信息建立了柑橘灌溉专家系统,但该系统仅采用无线通信的方式,在恶劣天气条件下抗干扰能力较差,无法准确稳定地传输环境信息,灌溉实时性和准确性不能保证。基于农业物联网技术,余国雄等[18]实现对荔枝园的远程环境监控和精准管控,吴久江等[19]对简易大棚种植草莓的水分利用率进行分析,使水分经济利用率得到一定的提高,但他们都未考虑环境因子对环境调控设备的依赖,在精准调控的实时性和准确性方面仍有不足。

    模糊控制作为一种模拟人类思维而不依赖于参数调节的推理规则,能够适应实时系统的非线性控制问题[20],已有相关研究将模糊控制应用于温室环境调控。韦玉翡等[21]基于环境参数模糊制定专家系统,实现对温室环境的智能调控,但监测的环境因子不够全面,未考虑土壤电导率对作物生长的影响。傅以盘等[22]利用模糊控制对大棚温度进行调节,将其数值稳定在合适范围内,但未对其他环境因子实现调控。由于环境因子对环境调控设备的依赖程度不同,环境调控设备对环境因子的影响并非一对一的关系,对多环境因子的精确调控策略需要结合专家知识。定性分析是一种依据专家的智慧、经验等进行决策的方法,将其与模糊控制相结合,有利于实现多环境因子的精确调控。

    针对现有的作物种植管控系统存在的种植环境监测不全面、环境调控实时性和准确性欠佳等问题,本文设计并开发了一种菜心种植的精准管控模型及系统,利用物联网设备实时监测菜心各生长阶段的环境因子并传输至云端服务器,同时管控平台调用基于模糊控制与定性分析的环境管控模型指导环境调控设备工作,最后开展了管控系统模式和人工管理模式性能的对比试验,以期为实现设施菜心种植生产的高质量管理提供参考。

    设施菜心管控模型及系统整体框架如图1所示,主要由环境监测设备、环境管控模型和环境调控设备3部分组成。在菜心种植基地部署气象综合站采集基地不同环境下的气象数据,部署土壤综合站采集土壤数据环境,基于RS-485和Modbus-RTU协议与数据处理单元进行通信;数据处理单元基于MQTT协议与云端服务器进行数据交换;云端服务器负责接收、存储、管理、分析数据以供管控平台调用。部署水肥一体灌溉机、智能控制机作为设施菜心的水肥供给及环境调控设备。环境管控模型对菜心生长环境进行分析,形成环境调控决策方案,通过管控平台调用水肥一体灌溉机及智能控制机,维持各环境处于适宜生长范围,实现作物的高产、稳产。

    图  1  设施菜心管控模型及系统框架
    Figure  1.  Framework of the management model and system for protected flowering Chinese cabbage

    设施菜心生长环境信息主要通过物联网设备采集并传输至云端服务器进行分析、存储,实现菜心生长环境的实时监测。基于物联网设备搭建气象综合站和土壤综合站收集菜心生长环境因子(空气温度、土壤温度、土壤湿度、土壤导电率)。菜心不同生长时期对生长环境的要求不同[23],具体环境要求由农艺专家制定,如表1所示。其中,种子发芽需要25~30 ℃的空气温度、达标的土壤温度和水分条件以保证菜心的正常生长发育;叶片生长期的空气温度要求在20~25 ℃,有利于菜薹形成期糖分积累,产出质量好、品质高的菜心。土壤电导率反映了土壤中的总盐量,土壤中的养分主要以离子形式分散在土壤中,如氮、磷、钾、钙、镁等元素,这些元素的含量将直接影响作物产量,同时也需要避免过量施肥导致土壤污染。气象综合站和土壤综合站中环境因子采集传感器的具体信息如表2所示。

    表  1  环境因子适宜范围
    Table  1.  Suitable range of environmental factors
    生长时期
    Growth period
    θ空气/℃
    Atmospheric temperature
    θ土壤/℃
    Soil temperature
    土壤相对湿度/%
    Soil relative moisture
    σ土壤/(mS·cm−1)
    Soil electrical conductivity
    种子发芽期
    Seed germination period
    25~30 25~30 60~80 0.1~0.2
    叶片生长期
    Leaf growth period
    20~25 20~35 70~90 0.2~0.3
    菜薹形成期
    Stalk formation period
    20~25 20~25 60~80 0.3~0.4
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    表  2  传感器具体信息
    Table  2.  Specific information of sensors
    传感器类型
    Sensor type
    数据传输方式
    Data transmission method
    型号
    Model
    详情
    Detail
    大气温、湿度
    Atmospheric temperature and humidity
    RS-485 威盟士VMS-3002-WS 温度精度为±0.5 ℃、相对
    湿度测量精度为±3%
    土壤温、湿度
    Soil temperature and humidity
    RS-485 威盟士VMS-3001-TR-*-N01 温度测量精度为±0.5 ℃、
    相对湿度测量精度为±3%
    土壤电导率
    Soil electrical conductivity
    RS-485 威盟士VMS-3001-TR-*-N01 分辨率为1 µS·cm−1、土壤
    电导率测量精度为±3% FS
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    将气象综合站和土壤综合站采集到的数据稳定传输至云端,是实现环境精准调控的前提,本研究底层传感器由两类构成,一是数据采集类传感器,二是设备执行类传感器。相较于无线传输,有线传输在面临恶劣天气时抗干扰性更强,而无线传输的成本更低。因此本研究采用无线传感网、有线通信相融合的组网设计,并接入生产环境中的风机、湿帘、控制箱等传感器设备,监控设备运行状态,对设备异常状况进行报警;同时依据传感器情况,采用RS-485结合Modbus-RTU协议的方式接入传感器设备,并使用MQTT协议,将数据内容传输到云端物联网平台,进行初步运算存储。

    由于无线信号抗干扰能力较弱且实验园夏季高频发生雷雨天气,因此选择485信号线将传感器与数据处理单元连接,传感器设备与数据处理单元通过标准RS-485通信接口进行数据传输,问询帧的地址码和功能码为1字节,起始地址、请求寄存器数量和校验码为2字节,应答帧的地址码、功能码和数据长度为1字节,回传数据内容和校验码为2字节。其中,地址码代表设备地址,在通信网络中是唯一的,多个传感器设备共用1条485总线,与数据处理单元连接构成1个综合站,每个传感器设备对应1个设备地址。地址码由用户设置,表明该信息来自何处;由于传感器设备只支持读取操作,因此将功能码固定为只读,寄存器地址0001H定义为空气温度(单位为0.1 ℃),只读操作;0002H定义为土壤温度(单位为0.1 ℃),只读操作;0003H定义为土壤湿度(单位为0.1% RH),只读操作;0007H定义为土壤电导率(单位为1 µS/cm),只读操作。校验码用于判断接收到的数据是否正确,避免传输过程中电子噪声或其他噪声的干扰。

    数据处理单元通过MQTT协议与云端进行数据交换,MQTT通信协议使用订阅和发布消息模式,实现农业数据的高效推送。在MQTT协议中,1个数据包由固定头、可变头、消息体组成。其中,固定头包含数据处理单元序列号、传感器设备地址码;可变头包含传输数据类型、协议版本等;消息体包含气象数据如空气温度、大气湿度、光照等。

    MQTT物联网传输协议具有网络连接速度快、实时性高、数据传输稳定、下位机系统高效稳定和环境参数精度高等特点,使得物联网设备监测菜心各生长阶段环境因子(空气温度、土壤温度、土壤湿度和土壤电导率)拥有较高的实时性。

    环境管控模型是实现菜心生长环境精准管控的关键,水肥一体灌溉机按照菜心各生长时期的需求,通过滴灌方式将水肥溶液输送到作物根部。智能控制机集成风机、灯光、湿帘等设备,为菜心提供精准、定量、定时的环境调控条件。开发设施菜心精准种植管控平台,调用布置在云端服务器的模糊调控模型,分析空气温度、土壤温度、土壤湿度和土壤电导率,做出相对应的环境调控决策,图2为管控平台界面。

    图  2  管控平台界面
    Figure  2.  Control platform interface

    环境调控系统工作过程如下:环境监测系统通过各种传感器采集温室内环境因子数据并传送至云端服务器;云端服务器一方面对数据进行预处理并保存,另一方面传达信号,控制环境调控设备的开启程度,以维持菜心的最佳生长环境;采集、接收数据后,管控平台将环境数据与根据专家知识设置的菜心各时期最优参数进行比较,得出偏差和偏差的变化率等,调用模糊调控模型得到各环境因子的模糊控制量,最后基于定性分析法形成精准的环境调控决策方案,控制水肥一体灌溉机和智能控制机进行适当的喷灌降温、喷洒肥料、开关大棚风机等操作,保证菜心的正常生长;反馈实施结果到管控平台,为后续优化提供依据。

    控制多因素环境变量稳定是设施菜心环境智能调控的关键。设施菜心生长环境变量相互联系、相互影响。如太阳辐射量过高,会导致温度升高,从而湿度降低等[17]。优秀的环境调控系统设计需考虑多因素环境变量的综合影响。本研究综合菜心不同生长阶段的环境因子,基于模糊控制和专家知识形成环境调控设备的最佳模糊调控模型,其结构如图3所示。其中,本研究的专家知识为农艺师根据菜心种植管理以及环境调控设备使用经验综合分析制定的数据库和规则库。

    图  3  模糊控制模型结构
    Figure  3.  Structure of fuzzy control model

    将环境监测系统采集到的环境因子的实时数据与设定的菜心生长环境因子适宜范围(表1)比较,获得空气温度偏差$ {E}_{{\rm{T}}1} $和偏差变化率$ \Delta {E}_{{\rm{T}}1} $、土壤温度偏差$ {E}_{{\rm{T}}2} $和偏差变化率$ \Delta {E}_{{\rm{T}}2} $、土壤湿度偏差$ {E}_{\rm{H}} $和偏差变化率$ \Delta {E}_{\rm{H}} $以及土壤电导率偏差$ {E}_{\rm{C}} $和偏差变化率$ \Delta {E}_{\rm{C}} $

    为保证设施菜心的环境变量处于最佳,设计二输入的模糊控制规则使调控模型处于动态稳定状态。将各环境因子偏差值和偏差变化率作为模糊控制模型的输入量,参考专家知识将输入值转化为模糊控制理论语言值,具体转换公式如下:

    $$ Y=\dfrac{4}{a-b}\left[X-\dfrac{a+b}{2}\right] \text{,} $$ (1)

    式中,$ X $为偏差值及其变化率,$ a $为论域上限,$ b $为论域下限,$ Y $为连续量。

    设定空气温度、土壤温度、土壤湿度、土壤电导率的偏差模糊集论域为$ [-3, 3] $,可分为7个等级{−3, −2, −1, 0, 1, 2, 3},这是输入值的量化过程。输入量偏差值的模糊语言值取:{NB=负大,NM=负中,NS=负小,Z=零中,PS=正小,PM=正中,PB=正大}。同理,输入量偏差值的变化率也根据上述方法划分3个等级模糊语言值:{N=负,Z=零中,P=正};模糊控制模型输出控制量的模糊值取:{NB=负大,NM=负中,Z=零中,PM=正中,PB=正大},结合专家知识将模糊输出语言值转化为各环境因子的模糊控制量。

    模糊调控模型具体规则如下:当偏差$ E $及其变化率$ \Delta E $较大时,应尽快消除偏差;当它们较小或为零时,需优先保持调控模型稳定性。模糊控制状态表如表3所示。

    表  3  模糊控制状态1)
    Table  3.  Fuzzy control states
    EE
    PZN
    PBPBPBPM
    PMPBPMPS
    PSPMPMZ
    ZPMZZ
    NSPSZNM
    NMZNMNB
    NBNMNMNB
     1) E:偏差,∆E:偏差变化率;P=正,N=负,NB=负大,NM=负中,NS=负小,Z=零中,PS=正小,PM=正中,PB=正大
     1) E: Deviation, ∆E: Change rate of deviation; P=positive, N=negative, NB=negative big, NM=negative medium, NS=negative small, Z=zero medium, PS=positive small, PM=positive medium, PB=positive big
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    根据模糊调控模型输出的各环境因子的模糊控制量,结合专家知识制定环境调控设备的调控规则。对于水肥一体灌溉机,采用定量控制的方式,依据设备最大极限浇灌量划分为0、25%、50%、75%和100% 5个调控等级。对于灯光、风机、湿帘等长时间运行设备,设备调控的影响程度与开启时间呈正比例关系,因此采用定时控制的方式,将设备开启时间划分为5个调控等级(0、2、4、6、8 h),相应调控规则如表4所示。

    表  4  环境调控设备控制规则
    Table  4.  Control rules for environmental control equipment
    模糊控制状态1)
    Fuzzy control
    state
    定量调控等级/%
    Quantitative
    regulation level
    定时调控等级/h
    Timing regulation
    level
    NB00
    NM252
    Z504
    PM756
    PB1008
     1) NB=负大,NM=负中,Z=零中,PM=正中,PB=正大
     1) NB=negative big, NM=negative medium, Z=zero medium, PM=positive medium, PB=positive big
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    然而,环境调控设备对环境因子的影响并非一对一的关系,如水肥一体灌溉机直接对土壤湿度和土壤电导率产生影响,间接对大气湿度、空气温度产生影响;水泵的开启程度和时间直接对土壤湿度、大气湿度产生影响,间接影响土壤温度、空气温度;在夏季当湿帘发挥降温加湿作用时,室内温度下降,湿度会略增加;打开风机进行通风换气,可以降低温度和湿度。因此需要采用定性决策的方法确定环境调控设备的调控量。

    将空气温度、土壤温度、土壤湿度、土壤电导率4个环境因子对控制设备的依赖程度分为5个等级:非常高(1.0)、高(0.8)、中(0.5)、低(0.3)、非常低(0),若依赖程度处于2个等级之间,则取这2个等级间的评定值。

    根据前期试验和专家意见得出空气温度、土壤温度、土壤湿度、土壤电导率4个环境因子受5个控制设备(湿帘、水肥一体灌溉机开启前需开启水泵)的影响程度,如表5所示。

    表  5  环境因子对环境调控设备的依赖程度
    Table  5.  Dependence degree of environmental factors on environmental control equipment
    设备
    Equipment
    空气温度
    Atmospheric temperature
    土壤温度
    Soil temperature
    土壤湿度
    Soil moisture
    土壤电导率
    Soil electrical conductivity
    水肥一体灌溉机
    Fertigation system
    0.3 0.3 1.0 1.0
    水泵 Water pump 0.3 0.3 1.0 0.8
    灯光 Light 0.5 0.5 0 0
    风机 Fan 0.8 0.8 0.3 0.3
    湿帘 Wet curtain 0.8 0.5 0.3 0
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    表5可计算评价模糊矩阵$ R $

    $$ {\boldsymbol{R}}=\left[\begin{array}{cc}\begin{array}{cc}0.3& 0.3\\ 0.3& 0.3\end{array} \begin{array}{cc}1.0& 1.0\\ 1.0& 0.8\end{array}\\ \begin{array}{cc}0.5& 0.5\\ 0.8& 0.8\end{array} \begin{array}{cc}0& 0\\ 0.3& 0.3\end{array}\\ \begin{array}{cc}0.8& 0.5\end{array}\begin{array}{cc}0.3& \;\;0\end{array}\end{array}\right] 。 $$ (2)

    按照公式(3),对模糊矩阵$ {\boldsymbol{R}} $最大特征值所对应的特征向量归一化,得到相对权重($ A $)。由公式(4)计算得到各控制设备的重要性评价系数矩阵($ {\boldsymbol{U}} $),在各环境因子控制存在耦合或设备调控量存在矛盾时,形成精准环境调控决策。

    $$ A={\left[0.670\,7,\,0.243\,4,\,0.546\,9,\,0.438\,0\right]}^{{\rm{T}}} \text{,} $$ (3)
    $$ {\boldsymbol{U}}={\boldsymbol{R}}\times A={\left[1.259\,1,\,1.171\,5,\,0.457\,0,\,1.026\,8,\,0.822\,3\right]}^{{\rm{T}}} 。 $$ (4)

    设施菜心管控系统试验在华南农业大学农业农村部华南热带智慧农业技术重点实验室试验基地进行,设有2个菜心种植区,占地300 ${{\rm{m}}}^{2}$,可种植1 000株菜心。试验基地针对菜心种植区部署气象综合站1套、土壤综合站10套、水肥一体灌溉机1套和智能控制机1台(控制10个风机、1个湿帘以及1套补光设备)。2个菜心种植区分别采用设施菜心管控系统模式和人工经验管理模式对菜心生长进行管理,1套气象综合站布置于2个菜心种植区之间,10套土壤综合站以五点采样法的分布形式分别布置于2个菜心种植区,采集土层表面5 cm的土壤环境因子数据。本试验种植的菜心品种为‘青梗皱叶迟菜心’,在高架上使用基质种植,基质由农艺专家配制,原料主要有泥炭、椰糠、珍珠岩和蛭石。菜心种植株距16 cm,行距16 cm。以2021年9月1日至2021年10月21日种植菜心的种子发芽期(9月1日至9月7日)、叶片生长期(9月8日至10月2日)、菜薹形成期(10月3日至10月21日)作为试验时期。

    为验证智能设施菜心管控系统性能,本文进行设施菜心管控模式性能对比试验,分别是管控系统模式和人工经验管控模式,比较环境调控的实时性和准确性。管控系统模式下,监测系统实时采集试验菜心种植区空气温度、土壤温度、土壤湿度和土壤电导率4个环境因子数据,通过模糊控制器得到环境因子模糊控制量,结合专家知识生成环境调控决策,指导智能控制机和水肥一体灌溉机调节菜心生长环境。人工经验管控模式下,种植者在工作时间内定时(06:00、12:00和18:00)测量环境因子数据,根据测量数据和人工经验控制环境调控设备,进而调节菜心生长环境。针对本文优选的4个关键环境因子,通过设施管控系统监测并记录菜心不同生长时期的数据,暂存在本地计算机内,用于试验结果对比分析。其中,种子发芽期数据336个、叶片生长期数据1 200个、菜薹形成期数据912个。

    计算环境因子超出菜心适宜生长范围后,经过系统或人工调控到适合生长范围内所需的时间,以此比较不同管理模式对环境因子调控的实时性,对应指标计算如公式(5)所示。

    $$ \left\{\begin{aligned} & {p}_{{\rm{t}}}=\dfrac{\displaystyle\sum \nolimits _{i=1}^{n}{t}_{{\rm{b}}i}-{t}_{{\rm{e}}i}}{24n}\,\;\;\;\;\quad 空气温度、土壤温度\\& {P}_{{\rm{t}}}=\dfrac{\displaystyle\sum \nolimits _{i=1}^{n}{T}_{{\rm{b}}i}-{T}_{{\rm{e}}i}}{n{P}_{{\rm{d}}}}\,\quad 土壤湿度、土壤电导率 \end{aligned}\right. \text{,} $$ (5)

    式中,${p}_{\rm{t}}$$ {P}_{\rm{t}} $分别为不同环境因子的实时性指标;$ n $为管控系统或人工介入调控的次数;$ {t}_{{\rm{e}}i} $为空气温度和土壤温度第 $ i $ 次超出适宜范围的时间,h;$ {t}_{{\rm{b}}i} $为调控空气温度和土壤温度第 $ i $ 次回到适宜范围的时间,h;$ {T}_{{\rm{e}}i} $为土壤湿度和土壤电导率第 $ i $ 次超出适宜范围的时间,d;$ {T}_{{\rm{b}}i} $为调控土壤湿度和土壤电导率第 $ i $ 次回到适宜范围的时间,d;$ {P}_{{\rm{d}}} $为菜心当前总生长天数,d。实时性指标越小代表实时性越好。

    统计环境因子处于菜心适宜生长环境范围内的频数(数据量),并计算其占总数据量的比例,以此比较不同管理模式对环境因子调控的准确性,对应指标计算如公式(6)所示。

    $$ {P}_{{\rm{a}}}=\dfrac{{D}_{1}}{D} \text{,} $$ (6)

    式中,$ {P}_{{\rm{a}}} $为准确性指标$ ;D $为本试验中记录的菜心生长各个时期对应环境因子的数据量;$ {D}_{1} $为环境因子处于菜心适宜生长环境范围内的频数。

    随机选取菜心3个生长时期(种子发芽期、叶片生长期、菜薹形成期)其中一天的空气温度和土壤温度作为对比,如图4所示。人工管理模式的空气温度大部分时间处于适宜范围之外,且这一情况存在于菜心生长的3个时期。管控系统模式的空气温度和土壤温度根据菜心生长时期变化而变化,基本处于适宜范围内;其中,土壤温度在整个叶片生长期都保持在适宜范围内。说明当空气温度和土壤温度超出适宜范围时,管控系统能及时调控使其快速回到适宜范围内。

    图  4  空气温度和土壤温度变化曲线
    Figure  4.  Variation curves of atmospheric temperature and soil temperature

    图5a、5b分别为菜心3个生长时期(种子发芽期、叶片生长期、菜薹形成期)土壤湿度和土壤电导率的平均日变化曲线。管控模式下的土壤湿度和土壤电导率变化总是先于人工管理模式,且调控趋势更强烈,反映出人工管理模式介入调控相对滞后,导致土壤湿度和土壤电导率几乎都处于适宜范围之外。土壤电导率反映了土壤营养物质的含量,人工管理导致土壤电导率偏低,不利于菜心生长;管控系统模式的土壤湿度和土壤电导率随着菜心生长时期的变化而及时改变,说明管控系统能够频繁介入调控使其处于适宜范围内。

    图  5  土壤湿度(a)和土壤电导率(b)变化曲线
    浅蓝色为种子发芽期,浅绿色为叶片生长期,浅黄色为菜薹形成期
    Figure  5.  Variation curves of soil moisture (a) and soil electrical conductivity (b)
    Light blue is for seed germination period, light green for leaf growth period, light yellow for stalk formation period

    统计菜心3个生长阶段各环境因子实时性试验结果,如图6所示。从平均实时性来看,3个生长阶段管控系统模式对环境因子的平均调控实时性分别为0.10、0.17和0.18,人工管理模式分别为0.37、0.41和0.43。管控模式调控的实时性明显比人工管理模式高,所需平均调控时间缩短50%以上,平均实时性提高62.50%。3个生长阶段管控系统模式对土壤湿度的平均调控实时性分别为0.05、0.01和0.03,对土壤电导率的平均调控实时性分别为0.01、0.02和0.03;人工管理模式对土壤湿度的平均调控实时性分别为0.36、0.23和0.24,对土壤电导率的平均调控实时性分别为0.50、0.31和0.42。人工管理模式对土壤湿度和土壤电导率的调控实时性与管控系统模式存在巨大的差距,形成这种巨大差距的原因可能是,当土壤湿度和电导率处于不利于菜心生长状况时,人工经验管理对土壤状况观测不及时、判断不准确等主观原因导致调控滞后,而管控系统的环境监测使土壤湿度和土壤电导率的实时调控成为可能,使得菜心始终处于适宜生长条件。

    图  6  实时性试验结果
    Figure  6.  Results of real-time experiments

    本试验管控系统模式和人工管理模式的各环境因子在菜心种子发芽期、叶片生长期和菜薹形成期的监测数据如表6所示。管控系统模式下各环境因子处于适宜范围内的频数均高于人工管理模式,其中土壤湿度和土壤电导率的优势最为明显。综合3个时期来看,土壤湿度和土壤电导率在管控系统模式下处于适宜范围内的频数分别为1 887和1 738,相比人工管理模式的484和102,分别有近3和16倍的提升;这是由于灌溉时间、灌溉方式、肥料比例对土壤湿度和土壤电导率的影响较大,依靠人工经验管理较难准确把握灌溉调控时机,而管控系统在准确的环境监测基础上能够做出及时精准的调控决策,因此调控效果优势明显。相对于土壤湿度和土壤电导率,管控系统对空气温度和土壤温度调控的优势较小,仅有不到1倍的提升;可能原因是与土壤湿度和土壤电导率相比,人工经验对于温度变化更为敏感,因此空气温度和土壤温度能够得到及时的调控。

    表  6  准确性监测结果1)
    Table  6.  Monitoring data of accuracy
    生长时期
    Growth period
    空气温度
    Atmospheric temperature
    土壤温度
    Soil temperature
    土壤湿度
    Soil moisture
    土壤电导率
    Soil electrical conductivity
    系统
    System
    人工
    Artificial
    系统
    System
    人工
    Artificial
    系统
    System
    人工
    Artificial
    系统
    System
    人工
    Artificial
    种子发芽期
    Seed germination period
    190/146 141/195 262/74 224/112 330/6 23/313 263/73 20/316
    叶片生长期
    Leaf growth period
    651/549 445/755 1 023/177 944/278 746/454 185/1 019 808/392 45/1 155
    菜薹形成期
    Stalk formation period
    513/399 252/660 725/187 513/377 811/101 276/632 667/245 37/875
    总计 Total 1 354/1 094 838/1 610 2 010/438 1 681/767 1 887/561 484/1 964 1 738/710 102/2 346
     1)“/”上方为处于适宜范围内的数据量,下方为偏离适宜范围的数据量
     1) The data above “/” are the amount of data in the appropriate range, and the data below “/” are the amount of data that deviate from the appropriate range
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    图7为管控系统模式与人工管理模式的准确性对比结果。对比3个时期试验结果发现,管控系统模式对4个环境因子的调控准确性均超过0.50,而人工管理模式下仅有土壤温度的调控准确性超过0.50。综合3个时期,对比人工管理模式,管控系统对空气温度、土壤温度、土壤湿度和土壤电导率的调控准确性分别有56.66%、20.33%、3.76倍和13.78倍的提升,平均准确性提高1.34倍。此外,人工经验管理模式在3个时期对土壤湿度的调控准确性均低于0.35,对土壤电导率的调控准确性均低于0.10,与管控系统模式存在较大差距。从平均准确性来看,管控系统模式在3个生长阶段对4个环境因子的平均调控准确性分别为0.78、0.68和0.74,人工管理模式分别为0.31、0.34和0.30。管控模式的调控准确性均为人工管理模式的2倍以上,说明人工管理由于环境观测滞后性较难对环境因子实现准确调控,导致菜心的生长环境无法长时间稳定地控制在适宜范围内,对菜心的健康生长造成负面影响。试验的准确性分析结果表明,管控系统对环境因子的调控准确性更优,更有利于菜心的生产管理。

    图  7  准确性试验结果
    Figure  7.  Results of accuracy experiments

    1)设计并开发了一种基于模糊控制的设施菜心生产环境管控模型及系统,主要由环境监测设备、环境管控模型和环境调控设备3部分组成,具有对菜心生长环境实时监控及准确调控的功能,实现了菜心生长高效管理,保证了菜心产量和品质。

    2)利用本研究的管控系统对菜心生长环境信息进行采集和传输,提高了获取环境信息的实时性。模糊推理与定性分析相结合的方法优化了环境因子控制量及环境调控设备的调控决策,提高了对环境因子调控的准确性。

    3)与传统人工管理模式对比,管控系统能够更及时、准确地监控和调控菜心生长环境,对比试验表明:管控系统模式的平均实时性提高62.50%,平均准确性提高1.34倍。

  • 图  1   4种不同噬菌体及两两混合对青枯菌Tb1556平板产生的噬菌斑

    Figure  1.   The plaques of four types of phages and their mixtures in pairs on Ralstonia solanacearum Tb1556 plates

    图  2   4种不同噬菌体及其两两混合对青枯菌Tb1556生长的影响

    柱子上不同小写字母表示差异显著(P<0.05,LSD法)

    Figure  2.   Effects of four types of phages and their mixtures in pairs on Ralstonia solanacearum Tb1556 growth

    Different lowercase letters on bars indicate significant difference (P<0.05,LSD method)

    图  3   噬菌体与青枯菌Tb1556共培养下的青枯菌D600 nm

    柱子上方的不同小写字母表示差异显著(P<0.05,LSD法)

    Figure  3.   D600 nm of Ralstonia solanacearum Tb1556 after co-culturing with phages

    Different lowercase letters on bars indicate significant difference (P<0.05,LSD method)

    图  4   噬菌体对脂多糖和膜蛋白的吸附率

    Figure  4.   Adsorption rates of lipopolysaccharide and membrane protein by phages

  • [1]

    RAHMANI R, ZARRINI G, SHEIKHZADEH F, et al. Effective phages as green antimicrobial agents against antibiotic-resistant hospital Escherichia coli[J]. Jundishapur J Microbiol, 2015, 8(2): e17744.

    [2]

    SARKER S A, SULTANA S, REUTELER G, et al. Oral phage therapy of acute bacterial diarrhea with two coliphage preparations: A randomized trial in children from Bangladesh[J]. Ebiomedicine, 2016, 4: 124-137.

    [3]

    WALL S, ZHANG J, ROSTAGNO M, et al. Phage therapy to reduce preprocessing Salmonella infections in market-weight swine[J]. Appl Environ Microb, 2010, 76(1): 48-53. doi: 10.1128/AEM.00785-09

    [4]

    WANG Y, BARTON M, ELLIOTT L, et al. Bacteriophage therapy for the control of Vibrio harveyi in greenlip abalone (Haliotis laevigata)[J]. Aquaculture, 2017, 473: 251-258. doi: 10.1016/j.aquaculture.2017.01.003

    [5]

    SUSIANTO G, FARID M M, DHANY N R, et al. Host range for bacteriophages that infect bacterial blight pathogen on soybean[J]. Proc Environ Sci, 2014, 20: 760-766. doi: 10.1016/j.proenv.2014.03.091

    [6]

    FLAHERTY J E, JONES J B, HARBAUGH B K, et al. Control of bacterial spot on tomato in the greenhouse and field with H-mutant bacteriophages[J]. Hortscience, 2000, 35(5): 882-884. doi: 10.21273/HORTSCI.35.5.882

    [7]

    FLAHERTY J E, HARBAUGH B K, JONES J B, et al. H-mutant bacteriophages as a potential biocontrol of bacterial blight of geranium[J]. Hortscience, 2001, 36(1): 98-100. doi: 10.21273/HORTSCI.36.1.98

    [8]

    BALOGH B, CANTEROS B I, STALL R E, et al. Control of citrus canker and citrus bacterial spot with bacteriophages[J]. Plant Dis, 2008, 92(7): 1048-1052. doi: 10.1094/PDIS-92-7-1048

    [9]

    SCHNABEL E L, FERNANDO W G D, MEYER M P, et al. Bacteriophage of Erwinia amylovora and their potential for biocontrol[J]. Acta Hortic, 1999, 489(489): 649-654.

    [10]

    RAVENSDALE M, BLOM T J, GRACIAl-GARZA J A, et al. Bacteriophages and the control of Erwinia carotovora subsp. carotovora[J]. Can J Plant Pathol, 2007, 29(2): 121-130. doi: 10.1080/07060660709507448

    [11]

    ADDY H S, ASKORA A, KAWASAKI T, et al. Loss of virulence of the phytopathogen Ralstonia solanacearum through infection by φRSM filamentous phages[J]. Phytopathology, 2012, 102(5): 469. doi: 10.1094/PHYTO-11-11-0319-R

    [12]

    ADDY H S, ASKORA A, KAWASAKI T, et al. Utilization of filamentous phage phi RSM3 to control bacterial wilt caused by Ralstonia solanacearum[J]. Plant Dis, 2012, 96(8): 1204-1209. doi: 10.1094/PDIS-12-11-1023-RE

    [13]

    FUJIWARA A, FUJISAWA M, HAMASAKI R, et al. Biocontrol of Ralstonia solanacearum by treatment with lytic bacteriophages[J]. Appl Environ Microb, 2011, 77(12): 4155-4162.

    [14] 康洁. 3种方法提取大肠杆菌E.coli脂多糖的比较[J]. 中国农学通报, 2010, 26(21): 12-15.
    [15] 余成鹏, 胡蓉花, 陈小强, 等. 江西和广东烟草青枯菌对噬菌体的敏感性及聚类分析[J]. 江西农业大学学报, 2018(4): 699-707.
    [16]

    WEI C H, LIU J L, MAINA A N, et al. Developing a bacteriophage cocktail for biocontrol of potato bacterial wilt[J]. Virol Sin, 2017, 32(6): 476-484.

    [17]

    BAE J Y, WU J, LEE H J, et al. Biocontrol potential of a lytic bacteriophage PE204 against bacterial wilt of tomato[J]. J Microbiol Biotechn, 2012, 22(12): 1613-1620. doi: 10.4014/jmb.1208.08072

    [18]

    MARRAFFINI L A. CRISPR-Cas immunity against phages: Its effects on the evolution and survival of bacterial pathogens[J]. PLoS Pathog, 2013, 9(12): e1003765. doi: 10.1371/journal.ppat.1003765

    [19]

    BARRANGOU R, FREMAUX C, DEVEAU H, et al. CRISPR provides acquired resistance against viruses in prokaryotes[J]. Science, 2007, 315(5819): 1709. doi: 10.1126/science.1138140

    [20]

    HYNES A P, VILLION M, MOINEAU S. Adaptation in bacterial CRISPR-Cas immunity can be driven by defective phages[J]. Nat Commun, 2014, 5: 4399. doi: 10.1038/ncomms5399

    [21]

    WEI Y, CHESNE M T, TERNS R M, et al. Sequences spanning the leader-repeat junction mediate CRISPR adaptation to phage in Streptococcus thermophilus[J]. Nucleic Acids Res, 2015, 43(3): 1749-1758. doi: 10.1093/nar/gku1407

    [22]

    SORENSEN M C H, van ALPHEN L B, HARBOE A, et al. Bacteriophage F336 recognizes the capsular phosphoramidate modification of Campylobacter jejuni NCTC11168[J]. J Bacteriol, 2011, 193(23): 6742-6749. doi: 10.1128/JB.05276-11

    [23]

    ZALESKI P. The role of Dam methylation in phase variation of Haemophilus influenzae genes involved in defence against phage infection[J]. Microbiology, 2005, 151(10): 3361-3369. doi: 10.1099/mic.0.28184-0

    [24]

    KIM M, RYU S. Characterization of a T5-Like coliphage, SPC35, and differential development of resistance to SPC35 in Salmonella enteric serovar Typhimurium and Escherichia coli[J]. Appl Environ Microb, 2011, 77(6): 2042-2050. doi: 10.1128/AEM.02504-10

    [25] 毛普加, 洪愉, 毛小萍, 等. 噬菌体受体及其鉴定方法[J]. 中国微生态学杂志, 2014(6): 731-734.
    [26]

    BAE H, CHO Y. Complete genome sequence of Pseudomonas aeruginosa podophage MPK7, which requires type IV pili for infection[J]. Genome Announc, 2013, 1(5): e00744-13.

    [27]

    NARULITA E, ADDY H S, KAWASAKI T, et al. The involvement of the PilQ secretin of type IV pili in phage infection in Ralstonia solanacearum[J]. Biochem Bioph Res Co, 2016, 469(4): 868-872. doi: 10.1016/j.bbrc.2015.12.071

  • 期刊类型引用(11)

    1. 李欣宇,叶尔江·拜克吐尔汉,王娟,张新娜,张春雨,赵秀海. 基于非线性混合效应模型的东北红松树高-胸径关系. 北京林业大学学报. 2025(03): 38-48 . 百度学术
    2. 程雯,武晓昱,叶尔江·拜克吐尔汉,王娟,赵秀海,张春雨. 基于混合效应和分位数回归的温带针阔混交林树高与胸径关系研究. 北京林业大学学报. 2024(02): 28-39 . 百度学术
    3. 王维芳,崔梦琦,邢凯然. 包含哑变量的大兴安岭天然白桦林碳密度模型. 森林工程. 2024(05): 74-81 . 百度学术
    4. 吕乐乐,王文彬,董灵波. 基于哑变量和分位数回归的兴安落叶松更新幼树的树高-胸径模型. 应用生态学报. 2023(09): 2355-2362 . 百度学术
    5. 夏洪涛,郭晓斌,张珍,田相林,郭福涛,孙帅超. 基于不同立地质量评价指标的杉木大径材林分树高-胸径模型. 中南林业科技大学学报. 2023(10): 80-88 . 百度学术
    6. 郭卫红,郑庆荣,胡砚秋,陈晓江,李眉红. 山西五台山主要针叶树种树高—胸径曲线模型研究. 湖南林业科技. 2022(06): 72-77 . 百度学术
    7. 王泳腾,黄治昊,王俊,张童,郎立华,孙国明,崔国发. 濒危植物黄檗的生存压力研究. 北京林业大学学报. 2021(01): 49-57 . 百度学术
    8. 陈浩,罗扬. 马尾松树高-胸径非线性混合效应模型构建. 森林与环境学报. 2021(04): 439-448 . 百度学术
    9. 张冬燕,王冬至,李晓,高雨珊,李天宇,陈静. 基于分位数回归的针阔混交林树高与胸径的关系. 浙江农林大学学报. 2020(03): 424-431 . 百度学术
    10. 邓楠,马丰丰,宋庆安,周满,杨蕊,李典军,彭湃,田育新. 环境梯度对杉木公益纯林分布特征及生长的影响. 湖南林业科技. 2020(04): 8-15 . 百度学术
    11. 韩辉,袁春良,张学利,宋鸽,安宇宁,孙晓辉. 基于林分生长量的沙地樟子松初植造林密度确定. 辽宁林业科技. 2020(06): 1-9+58 . 百度学术

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出版历程
  • 收稿日期:  2019-04-15
  • 网络出版日期:  2023-05-17
  • 刊出日期:  2020-03-09

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