北京鸭呼肠孤病毒σA、σB蛋白的二级结构及B细胞抗原表位的预测
Secondary Structure and B Cell Epitopes Prediction of Protein σA and σB of Reovirus Strain DRV-GZ from Peking Ducks
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摘要: 应用SOPMA方法和DNAStar Protean软件综合分析了北京鸭呼肠孤病毒分离株DRV-GZ株的σA、σB蛋白的二级结构、亲水性、表面特性、柔韧性和抗原指数,并对各个蛋白的B细胞抗原表位进行了预测.结果表明,σA蛋白的32~37,56~61,82~85,107-116,128-141,202~207,239~246,256~260,274~280,312~317,381~391和σB蛋白的62~86,117~123,141~163,179~186,270~275,287~289,343~345区域内或附近最有可能是B细胞抗原表位的优势区域.